说明:UMAMI运输机功能表征
任务:
拉詹:
在拟南芥中获取UMAMI基因
从bioMart获取蛋白质序列
针对小麦基因组的蛋白质爆炸:评估值截断了1e-10
后期处理:每个拟南芥UMAMI基因的前10个小麦基因(总共129个基因)
获取选定小麦基因的核苷酸序列
每个拟南芥UMAMI基因与其前10个小麦blastp匹配的基于肌肉的多序列比对(MSA),邻域连接系统树(以编程方式使用EBI REST API)
使用NGphylogeny.fr组合的所有小麦和拟南芥UMAMI基因的最大似
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