文件名称:
GenomicSQLite-examples-源码
开发工具:
文件大小: 5kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-28
详细说明：GenomicSQLite示例
此存储库展示了一个使用的小型示例程序，该程序以几种受支持的编程语言实现。 这是您进入自己的程序的最小起点。 有关完整的文档，请参见《 。
程序gsqlex load exons.gff exons.db一个小的导入数据库， gsqlex load exons.gff exons.db基因组范围进行索引。 然后， gsqlex query exons.db chr17:43,104,800-43,105,000打印与给定基因组范围重叠的记录。
以下所有示例调用均从此存储库的根目录开始。
Python
$ pip install genomicsqlite
$ python/gsqlex.py load exons.gff exons.db
$ python/gsqlex.py query exons.db chr17:43,104,800-43,105,
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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