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NAMD入门教程
1. 分子动力学模拟概论 1.1 分子动力学模拟的发展 1.2 分子动力学模拟的基本原理 1.3 分子动力学模拟相关软件 2. 分子动力学入门 2.1 基本设置 2.2 生成蛋白质结构文件(PSF) 2.3 蛋白质的溶质化 2.4 球状水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟 2.5 立方水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟 2.6 简单的结果分析 3. 分析方法 3.1 平衡态分子动力学模拟分析 3.1.1 每个残基的RMSD值 3.1.2 麦克斯韦-波尔兹曼(Maxwe
所属分类:
专业指导
发布日期:2013-05-14
文件大小:1mb
提供者:
u010696678
Quantity One
凝胶电泳是每个做分子生物学的同学天天都要打交道的基本技术。电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。目前有大量软件可以用于分析电泳结果,比较有名的比如BandScan、BandLeader、Sigma Gel等等。今天要向大家介绍的是来自Bio-Rad的1D凝胶定量软件QuantityOne(Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest)。这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的主页免费下载。 2 Quantity One的定量方法
所属分类:
软件测试
发布日期:2013-08-27
文件大小:18mb
提供者:
u011840350
The Neuron Book
介绍Neuron软件使用的教程书. 这本书开辟了新的可能性。它包括一个基本的简单的图形用户界面(GUI ),可以在Microsoft Windows中使用(事实上使用它的例子) 。我评分4颗星,而不是5 ,因为示例中的说明是针对那些有经验的神经元。对于初学者像我这样的,这将有助于说哪些按钮应该被点击,哪些键按下。 这本书介绍了神经元的模拟系统,它可以为在神经元网络现场安装指令访问。模拟意味着使用现实霍奇金 - 赫胥黎神经元。神经元最初的单个神经元,但现在已经扩展到网络。 对于那些谁相信在19世
所属分类:
医疗
发布日期:2013-12-06
文件大小:4mb
提供者:
zhangbinzhangbin888
EDA/PLD中的生物芯片扫描仪硬件电路设计
摘要:介绍了自动设计的生物芯片扫描仪的硬件电路及其配套软件的设计。核电路以DSP为核心处理器,以单片机为从处理器,并结合CPLD、USB、A/D、D/A等各种芯片构成。生物芯片扫描仪的研究成功,将推动我国生物芯片技术的发展。 关键词:生物芯片扫描仪 生物芯片检测技术 DSP USB2.0生物芯片技术是20世纪末发展起来的一项新技术。生物芯片是在微小面积上,利用微加工技术,并结合有关的化学合成技术制造而成的一种具有一定分子生物学检验功能的微型器件。分析和解释生物芯片上得到的信息,将在DNA结
所属分类:
其它
发布日期:2020-12-10
文件大小:109kb
提供者:
weixin_38628310
分子生物学软件介绍
美食该如何制作?食品安全以什么为标准?用什么来检测食品成分?这么一份分子生物学软件介绍来为你解开心...该文档为分子生物学软件介绍,是一份很不错的参考资料,具有较高参考价值,感兴趣的可以下载看看
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-01
文件大小:103kb
提供者:
weixin_38750644
bio-class-deb10:基于Debian 10的生物类的云初始化-源码
基于Debian 10 Buster的生物课 使用为生物学学生建立虚拟教室的存储库 vvi的ASCR分子遗传学研究所对基因表达类的tought的分析 基因组学:ASCR分子遗传学研究所的算法和分析类难题,vvi 具有已安装软件的图像 最好使用准备好的包含所有必需软件的映像debian-9-x86_64_bioconductor。 介绍了以下某些步骤,并提供了指南。 如果采取手动操作,请。 SSH访问 使用您的, 连接到实例,或者请参阅 和或请参阅: ssh -A -X -i ~/.ssh/id
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:2mb
提供者:
weixin_42131352
SingleMoleculeFootprinting:用于SMF数据分析的R包-源码
单分子印迹 介绍 SingleMoleculeFootprinting是围绕构建的R软件包,专门用于分析单分子足迹(SMF)数据。 SMF是在开发的一种高通量测序技术。 它包括使用外源甲基转移酶在GpC和CpG环境中标记可及的基因组胞嘧啶,以及随后进行的亚硫酸氢盐测序(BS)。 因此,受DNA相互作用蛋白(例如TF,核小体,GTF等)结合保护的胞嘧啶将被甲基化,而可及的胞嘧啶将被甲基化。 使用本程序包,我们提供了从对齐的bam文件到单个站点结果的生物学解释,执行基本SMF数据分析的功能。 前
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-24
文件大小:4mb
提供者:
weixin_42176827
RNA二级结构预测方法综述
RNA二级结构预测是计算分子生物学中的一个重要领域.本文介绍了RNA二级结构的预测方法,包括该问题的数学模型、主要算法思想以及每种算法对应的软件.在tRNA和RNase P RNA数据库中随机选取了几组样例对目前主要的7种软件进行测试,同时对每种软件的优缺点进行了详细比较.实验证明,当存在同源序列时,Pfold的效果优于其它软件.最后,在总结分析现有算法的基础上探讨了该领域进一步的研究方向.
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:389kb
提供者:
weixin_38617335
ProteinVR:Protein Virtual Reality是匹兹堡大学与Jacob D. Durrant博士合作的项目,这是世界上第一个为大学生物学课程量身定制的解剖学和蛋白质可视化VR程序-源码
ProteinVR:虚拟世界中的微观和结构生物学 介绍 这项工作于2020年3月发表在《 。 ProteinVR:虚拟世界中的微观和结构生物学是匹兹堡大学计算药物发现博士Jacob D. Durrant博士实验室( )的一项革命性科学事业。 我们力求利用价格便宜的新型虚拟现实技术的力量,成为有史以来首个可帮助广大科学观众学习解剖学和分子生物学的软件。 该软件最初是针对大学水平的学生量身定制的,但可以针对中学教育进行调整。 我帮助修改了该项目并提供了反馈,最终获得了25,000美元的资金。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-06
文件大小:24mb
提供者:
weixin_42106765