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搜索资源 - 变量重新映射:用于在两个任意FASTA程序集之间重新映射VCF变量的管道-源码
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变量重新映射:用于在两个任意FASTA程序集之间重新映射VCF变量的管道-源码
变量重映射 用于以FASTA格式在两个任意程序集之间重新映射VCF变量的管道。 不需要链文件。 方法:从每个变体的侧翼序列创建读段,然后使用bowtie2将它们映射到新的程序集。 目前,它仅是SNP和短indel,但尚未通过更大或更复杂的变体进行测试。 先决条件 要运行此管道,您将需要安装和配置 。 管道使用需要在本地下载和安装的其他软件。 您可以手动获取它们,也可以使用 。 使用conda安装 git clone https://github.com/EBIvariation/varian
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-25
文件大小:29696
提供者:
weixin_42117032