与Sanger测序相比，下一代测序平台可产生更短的读数，更高的覆盖范围和更高的通量。 这些成本最低的技术可以在一天内运行，从而覆盖大多数物种，包括哺乳动物。 这些仪器之一产生的序列数据由数百万或数十亿的序列读段组成，长度范围从50到150nt。 在开始进一步的基因组分析之前，必须从头开始组装这些短读物。 不幸的是，由于许多原因，基因组组装仍然是一个难题，特别是短读段和比读段更长的复杂重复结构。 最近有很多组装算法和软件，其中大多数算法面对重复时显得*为力，尤其是对于相同的重复算法，并且在完全相