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基于基因表达式编程的递归函数挖掘.doc
摘 要:为了解决传统基因表达式编程(GEP)无法发现多模函数的所有最优解的问题,将小生境概念引入到基因表达式编程中。分析了传统GEP算法在多模函数优化方面的不足,提出了小生境半径的自适应调整策略AMNR,提出了基于小生境基因表达式编程的多模函数优化算法NGEP-MFO。扩展了传统GEP的应用领域,实验表明,相对于传统GEP,NGEP-MFO能大幅提高发现所有最优解的成功率和判定最优解的准确度。 关键词:基因表达式编程;小生境;多模函数优化;多目标优化
所属分类:
其它
发布日期:2009-06-10
文件大小:119kb
提供者:
xcstree
基因治疗微链载体的构建及表达分析
微链载体利用设 计好的Cap 序列封闭基因表达框两端, 起到防止细胞内核酸外切酶降解的作用
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-06-19
文件大小:1mb
提供者:
luoyunsong
几种基因调控网络的比较
随着高通量生物学技术的发展与普及,系统生物学得以建立,并且迅速发展。本文简要介绍了系统生物学的概念,基本方法,研究内容。复杂网络理论的建立使得许多生物问题都找到了数学方法,促使生物系统网络模型构建起来,如生态网络、代谢网络、蛋白质网络以及基因调控网络。复杂网络模型将各种生物系统抽象成网络,通过对这种网络的分析研究,获得生物体结构和功能的信息和新认识。更进一步,通过模拟构建好的理论模型,可以观察该模型的动力学性质及演化过程,这样,就能从最为本质的层面揭示生命的活动规律。
所属分类:
网络基础
发布日期:2009-09-07
文件大小:3mb
提供者:
zhangtt427
phylip进化分析工具
PHYLIP软件是一个免费的集成的进化分析工具,有华盛顿大学遗传学系Joseph felsenstein 编写,1980年首次释放,目前已经升级到3.6.7版本。PHYLIP包含了35个程序,这些程序基本上囊括了系统发生分析方面的所有方面,并且可以在很多平台上运行。包括分子程序组、距离程序组、基因频率组、连续字符组、不连续字符组和进化树绘制组。
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-12-16
文件大小:1mb
提供者:
bbc1172000
常用生物数据分析软件
第 1 章 Unix/Linux操作系统介绍...........................................................................................................1 1.1 远程登陆..............................................................................................................
所属分类:
嵌入式
发布日期:2010-08-04
文件大小:6mb
提供者:
shambalas
差异基因分析
美国斯坦福大学开发的基因芯片差异基因分析EXCEL插件,简单方便
所属分类:
教育
发布日期:2013-03-08
文件大小:10mb
提供者:
xylapple2013
真核生物基因组的基因分析和预测相关代码
真核生物基因组的基因分析和预测相关代码 加深基因预测基本原理的理解(如 密码子的偏好性、内含子外显子剪切识别序列等); 了解同源基因预测的意义所在; 熟悉已有的基因预测的使用(如GenScan、GeneWise等);
所属分类:
专业指导
发布日期:2018-07-17
文件大小:40mb
提供者:
qq_29300341
基因序列分析软件
可以分析基因序列,酶切位点,引物设计,序列对比等,方便实用
所属分类:
教育
发布日期:2018-03-05
文件大小:3mb
提供者:
sinat_41789546
东京大学基于Sun的解决方案配置日本最大基因分析系统
人类基因组研究中心(HGC)是日本东京大学医学科学院的一个分部,它配置了一组Sun Fire:trade_mark: 15000服务器,用作HGC的人类基因组分析系统。基于Sun的这一高端64位服务器的优异性能,该中心的人类基因组分析系统顺利启动,成功运行。
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-04
文件大小:93kb
提供者:
weixin_38626032
基于Sun解决方案的日本最大的基因分析系统
人类基因组研究中心(HGC)是日本东京大学医学科学院的一个分部,它配置了一组Sun Fire:trade_mark: 15000服务器,用作HGC的人类基因组分析系统。基于Sun的这一高端64位服务器的优异性能,该中心的人类基因组分析系统已于2003年1月1日起顺利投入运行。东京大学的这一基因组分析系统是全球第二大Sun Fire 15000服务器的超级集群系统。
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-04
文件大小:21kb
提供者:
weixin_38688969
杨树全基因组NBS类型抗病基因分析
杨树全基因组NBS类型抗病基因分析,吴大强,蔡诚,本研究对杨树(Populus trichocarpa)中含有核苷酸结合区(NBS)结构的候选抗病基因进行了全基因组的分析研究,包括NBS类型基因总量的的�
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-02
文件大小:373kb
提供者:
weixin_38631049
支原体基因组核心与种内特异必需基因分析
支原体基因组核心与种内特异必需基因分析,林岩,,支原体是重要的病原菌,也是合成生物学中的关键角色。支原体必需基因集的组成和种间分布对理想底盘的构建十分重要。使用生物信息
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-22
文件大小:667kb
提供者:
weixin_38530536
遗传性血小板无力症家系病例的突变分析三例.pdf
目的 运用生物信息学软件探讨3个遗传性血小板无力症家系的分子发病机制,为体外 实验提供依据。方法 对3个确诊遗传性血小板无力症家系进行基因分析。采用ClustalX⁃2.1⁃win软 件分析突变位点同源序列保守性;采用PolyPhen⁃2、PROVEAN、SIFT、MutationTaster 等软件分析突变 位点危害性;采用spdbv软件构建突变蛋白结构模型,分析突变位点对蛋白质结构影响。
所属分类:
医疗
发布日期:2020-02-13
文件大小:2mb
提供者:
marshlin
31个重要小麦品种抗叶锈性基因分析
31个重要小麦品种抗叶锈性基因分析 ,张换换,李在峰,选择来自河北省和山西省的31个小麦品种以及37个含有已知抗锈病基因的载体品种,在苗期接种20个毒力不同的生理小种进行抗病鉴定,并
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-13
文件大小:604kb
提供者:
weixin_38547532
水稻粉质突变体OsPDIL1-1的基因定位和候选基因分析
水稻粉质突变体OsPDIL1-1的基因定位和候选基因分析,韩小花,陈红,谷类作物种子内淀粉的积累对于作物产量的形成具有极为重要的意义。种子淀粉的生物合成是各种酶催化的过程,这一模型已经初步建立
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-30
文件大小:462kb
提供者:
weixin_38725734
快速进展的脊髓性肌萎缩症IIIb型一例临床及基因分析
快速进展的脊髓性肌萎缩症IIIb型一例临床及基因分析,单晶莉,林鹏飞,目的:报道一例经临床、病理及基因分析诊断为脊髓性肌萎缩症IIIb型的患者,探讨其临床特点尤其是罕见的快速进展病程,以及分子遗�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-05
文件大小:473kb
提供者:
weixin_38611254
改进的主成分分析法对拟南芥基因的分析
对拟南芥的幼苗进行不同盐浓度的处理,然后提取株系的RNA进行RNA-SEQ分析。为了能够对这些基因数据进行精确的分析,将对拟南芥幼苗的基因数据进行两步处理,首先对这些数据进行评估,包括对这些数据进行极差归一化,做直方图,使得对这些数据有大概的了解;然后提出了改进的主成分分析法的基因分析算法。改进的主成分分析法不仅包含了原始基因数据的全部信息,而且弥补了传统主成分分析法的缺陷,可以处理数据的非线性特征,还反映了数据间的变异信息,使得数据的处理更加简明、准确。结果表明,盐胁迫对拟南芥DNA到RNA(
所属分类:
其它
发布日期:2020-10-17
文件大小:302kb
提供者:
weixin_38679651
parallel-domestication:用于平行驯化基因分析-源码
parallel-domestication:用于平行驯化基因分析
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:3kb
提供者:
weixin_42117622
Spark技术在基因序列分析中的应用
生命科学方兴未艾,从食品工业中的细菌培养鉴定到癌症快速诊断,基于DNA分析的应用不断出现,但同时基因分析应用也面临着很大挑战;许多新技术、新方法被应用到基因序列分析应用中,包括Spark、FPGA以及GPU协处理器加速等,这些技术的应用不仅能够使大部分生命科学领域的应用,包括开源和ISV软件,在不需要复杂的MPI编程情况下实现并行化处理,同时Spark内存内计算技术也能够提高分析效率,加速工作流程,缩短分析时间,从而有更多新的发现。本文将介绍如何利用Spark技术运行常用的基因序列分析应用,包括
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-25
文件大小:747kb
提供者:
weixin_38743084
Spark技术在基因序列分析中的应用
生命科学方兴未艾,从食品工业中的细菌培养鉴定到癌症快速诊断,基于DNA分析的应用不断出现,但同时基因分析应用也面临着很大挑战;许多新技术、新方法被应用到基因序列分析应用中,包括 Spark、FPGA以及GPU协处理器加速等,这些技术的应用不仅能够使大部分生命科学领域的应用,包括开源和 ISV软件,在不需要复杂的MPI编程情况下实现并行化处理,同时Spark内存内计算技术也能够提高分析效率,加速工作流程,
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-29
文件大小:747kb
提供者:
weixin_38594252
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