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机器学习和深度学习个人笔记合集
Machine Learning(机器学习)是研究计算机怎样模拟或实现人类的学习行为,以获取新的知识或技能,重新组织已有的知识结构使之不断改善自身的性能。它是人工智能的核心,是使计算机具有智能的根本途径,其应用遍及人工智能的各个领域,它主要使用归纳、综合而不是演译。在过去的十年中,机器学习帮助我们自动驾驶汽车,有效的语音识别,有效的网络搜索,并极大地提高了人类基因组的认识。机器学习是当今非常普遍,你可能会使用这一天几十倍而不自知。很多研究者也认为这是最好的人工智能的取得方式。在本课中,您将学习
所属分类:
机器学习
发布日期:2019-04-17
文件大小:81mb
提供者:
action_now_
Physalia_ML-源码
Physalia_ML 生物学家的机器学习,动手入门 授课教师: Pietro Franceschi,Filippo Biscarini 提要使用现代定量技术表征复杂现象是几乎每个研究领域的标准方法。 生物学也不例外,并且在生命科学的方方面面都广泛使用多组学技术(代谢组学,转录组学,基因组学和蛋白质组学)。 最终的多元数据集非常复杂,需要应用高级数据分析方法来优化检索到的信息。 对于相对大规模的研究,机器学习是补充经典多元统计方法的有效工具。 本课程的目的是突出这些数据分析方法在生物学研究中
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42101384
computational-genomics:天普大学的计算基因组学课程-Jody Hey教授-源码
计算基因组学 天普大学的计算基因组学课程-Jody Hey教授 持有班上的所有模块(每周约1个)。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:57mb
提供者:
weixin_42165018
Msc_Digital_Health-源码
Msc_Digital_Health 该存储库用于介绍基因组_assembly_workshop 课程 : 打开getting_started.pptx 然后在powerpoint folder ASSEMBLY_WORKSHOP.pptx 。 按照提示进行操作,并在提示时打开其他文件。 剧本 shell scr ipts文件夹包含您需要的shell。 使用以下命令打开: Notepad++ 。 这是文本编辑器的王者! Filezilla是用于传输文件的ACE。 享受! 课程作业 序
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:18mb
提供者:
weixin_42144201
dragonstar2019-源码
龙之星2019 该GitHub存储库包含演讲幻灯片以及2019年Dragon Star生物信息学课程的计算练习。 这是一个为期五天的课程,主题为“人类疾病的基因组学”。 课程内容如下: 第一天 疾病研究中的基因组技术:, NGS数据格式和变式调用:, 第二天 短/长读序列数据的比对:, 通过短读/长读测序进行基因组组装:, 第三天 人类疾病中结构变异的检测:, 基因变异的注释和表型驱动的解释:, 第四天 SNP和基于序列的全基因组关联研究(GWAS):, 稀有变种和从头变种关联研究:, 生
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-15
文件大小:41mb
提供者:
weixin_42126865
course_Systems_Biology:天津医科大学,生物医学工程与技术学院,《系统生物学》课程资料-源码
course_Systems_Biology-《系统生物学》课程资料 简介 学校:天津医科大学 学院:生物医学工程与技术学院 专业:生物信息学 内容 导论 基因组学 转录组学 表型组学 文件夹 实验:实验课素材 计划:教案 显示:课堂演示素材 幻灯片:理论课幻灯片 集合:收集的备用素材
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:463mb
提供者:
weixin_42109639
DSA-源码
加州大学圣地亚哥分校和美国国立研究大学高等经济学院提供的数据结构和算法专业 这种专业化的内容,可以发现的coursera 该课程涵盖了基本算法技术和针对实际应用中经常出现的计算问题的思想:排序和搜索,划分和征服,贪婪算法,动态编程。 我们将学到很多理论:如何对数据进行排序以及如何对数据进行搜索; 如何将大问题分解并递归解决; 贪婪地进行下去的时候; 在基因组研究中如何使用动态编程。 您将练习解决计算问题,设计新算法并有效实施解决方案(以使它们在不到一秒钟的时间内运行)。 本课程的内容,可以发
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:6mb
提供者:
weixin_42119358
PopulationGenomicsCourse:BiRC的人口基因组学课程-源码
2020年人口基因组学 描述 课程结束后,学员将对进行典型人群基因组研究所需的方法和应用有详细的了解。 参加者必须在课程结束时能够: 确定与种群基因组分析相关的实验平台。 应用常用的种群基因组方法。 解释常见种群基因组方法背后的理论。 反思种群基因组方法的优势和局限性。 解释和分析总体基因组推论的结果。 根据数据制定人口遗传学假设 该课程介绍了人口基因组学中的关键概念,从生成种群遗传数据集到最常见的种群遗传分析和关联研究。 本课程的第一部分着重于群体遗传数据集的生成。 第二部分介绍
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:19mb
提供者:
weixin_42105816
algorithmic-toolbox-源码
Coursera:算法工具箱 该存储库包含Coursera提供的课程所有解决方案。 分配解决方案在Python3中。 关于本专业 该专业涵盖用于解决计算机科学应用程序中出现的问题的算法技术。 它是理论与实践的结合:您不仅可以设计算法并估算算法的复杂性,而且可以通过以自己选择的编程语言(C,C ++,C#,Haskell,Java, Javascr ipt,Python2,Python3,Ruby和Scala)。 该专业化是独特的,因为它提供了两个真实的项目。 “图上算法”课程的末尾提供了“高级
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:4mb
提供者:
weixin_42098892
learning-bioinformatics-at-home:学习生物信息学的资源-源码
在家学习生物信息学 和其他贡献者收集了一些资源,以帮助人们在家学习生物信息学工具(基本的和专业的)。 表中的内容 的Unix 介绍 :假设没有任何以前的经验,则每天直播生物信息学课程。 中间的 先进的 流程替代 一线生物信息学 [R 介绍 :Dana Farber的Rafael Irizarry的课程 :DESeq2和其他R包的作者Mike Love编写的教程 中间的 :基因组规模测定的结构,注释,归一化和解释(免费edX课程) :由Tidyverse和其他许多东西的开发者Hadley Wi
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:4kb
提供者:
weixin_42160252
metagenomics:元基因组学-源码
课例 该存储库显示了如何使用创建课程,它本身就是使用该模板的示例。 有关此材料的渲染版本,请参见 ,包括有关设计,设置和格式的详细说明。 快速说明 不要直接在GitHub上叉这个库。 相反,请按照设置说明中,通过从导入材料来为您的课程创建存储。 创建存储库后,运行bin/lesson_initialize.py创建标准的特定于课程的文件。 您必须在_config.yml编辑多个值,以便GitHub Pages可以正确呈现您的课程。 请阅读以格式化您的资料。 请将课程的主副本保留在存储库的
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:8mb
提供者:
weixin_42119866
基因组基因组学课程-源码
基因组基因组学课程 欢迎来到我的GitHub存储库!
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:28mb
提供者:
weixin_42099530
AppliedGenomics2021:2021年Spring应用基因组学课程材料-源码
JHU EN.601.749:计算基因组学:应用比较基因组学 教授: (mschatz cs.jhu.edu) TA: (arun.das jhu.edu) 上课时间:星期一+星期三 1:30p-2:45p(缩放)(有关链接,请参见) 沙茨办公时间:预约办公时间:星期一12-1pm,需要预约 本课程的主要目标是使学生具有理论基础,并让该课程有权进行独立的基因组分析。 我们将研究从原始测序数据开始的用于比较和分析基因组的领先计算和定量方法。 该课程将侧重于人类基因组学和人类医学应用,但是这
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其它
发布日期:2021-02-25
文件大小:76mb
提供者:
weixin_42159267
机器学习-斯坦福大学:课程由Andrew Ng教授-机器学习(斯坦福大学)-源码
斯坦福大学的机器学习(Coursera) 吴国安教授 介绍 “机器学习是使计算机在不经过明确编程的情况下运行的科学。在过去的十年中,机器学习为我们提供了无人驾驶汽车,实用的语音识别,有效的网络搜索以及对人类基因组的广泛理解。” 课程中包含的主题: 有监督的学习:参数/非参数算法,支持向量机,内核,神经网络。 无监督学习:聚类,降维,推荐系统,深度学习。 机器学习的最佳实践:偏差/方差理论,机器学习和AI的创新过程。 案例研究和应用:智能机器人(感知,控制),文本理解(网页搜索,反垃圾
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:75mb
提供者:
weixin_42099530
Bioinformatics-1:在DNA中查找隐藏的消息-源码
在DNA中查找隐藏的消息(生物信息学I) 本课程开始一系列课程,说明现代生物学中计算的功能。 请加入我们在生物信息学前沿的研究,以寻找DNA中隐藏的信息,而无需穿上实验服。 在课程的前半部分,我们将研究DNA复制,并提出一个问题:DNA复制在基因组中的何处开始? 我们将看到,仅使用一些简单的算法即可在基因组中寻找隐藏的信息,从而可以回答许多细菌的这个问题。 在课程的后半部分,当我们询问哪种DNA模式在分子钟中发挥作用时,我们将研究另一个生物学问题。 您体内的细胞设法维持昼夜节律,但是如何在
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:34kb
提供者:
weixin_42164702
生物信息学-作业:“生物信息学”课程的作业-源码
生物信息学作业 我为生物信息学课程,尤其是基因组实验室的作业提供的解决方案。 每个文件夹均包含实验文本和Python建议的解决方案。 概要 实验室主题: 基因组数据的基本操作(随机FASTA文件生成器,统计提取,FASTA文件比较)和共识区域 使用动态编程进行全局和局部对齐 搜索单核苷酸多态性(SNP)及其缺失; 蛋白质编码基因的原始读取计数 T检验,用于差异基因表达分析; 使用基因表达数据的A型/ B型Luminal乳腺癌亚型分类器
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其它
发布日期:2021-02-12
文件大小:703kb
提供者:
weixin_42105169
生物信息学:处理遗传序列以从中获得相关信息的算法-源码
生物信息学(正在进行中) 该存储库是关于与生物信息学问题解决方案相关的脚本的。 每个脚本执行不同的功能,以便从基因组或生物学数据中分析和提取有价值的信息。 此处要考虑的问题分别来自加利福尼亚大学圣地亚哥分校的Coursera专业化课程和“生物信息学”和“生物学与程序设计:初学者的生物信息学”课程。
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其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42102220
BI586:2021年生态和进化基因组学-源码
BI586 生态与进化基因组学2021 #PandemicVersion 这是将放置所有讲座/实验室材料的空间。 您也可以在此处访问课程表和时间表: : 第1课:可根据要求提供基本的DNA-RNA-蛋白质和历史介绍[文件太大,无法在此处托管] 讲座2:介绍SCC链接: Linux的小抄: SCC作弊工作表: : 如果您仍在Linux中寻找更多实践,请访问: : 讲座3:去了Linux的硬件和介绍RStudio: (访问密码:76accD P 2)如果你还在寻找中的R多
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其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42105816
genomics-r-intro:R和RStudio的基因组学简介-源码
R和RStudio基因组学简介 发展中的教训。 如何贡献? 该存储库使用GitHub Actions构建和部署课程。 应针对main分支机构做出贡献和拉取请求。 合并您的文稿后,Travis将负责使用R将Rmd文件处理为markdown文件,并将它们推入gh-branch ,GitHub将其用作本课程网站的服务。 个别情节文件位于_episodes_rmd文件夹中。
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其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:2mb
提供者:
weixin_42098251
web-BIOS-25328:癌症基因组学课程-源码
癌症基因组学-BIOS 25328-页面 为了使该设置生效,您需要在计算机上安装blogdown和hugo。 install.packages('blogdown') blogdown::install_hugo() 将存储库克隆/拉入本地副本 双击lab-notes.Rproj打开RStudio。 通过在source面板顶部的addin选项中添加New Post来开始新的分析 选择标题,作者,标签 在格式中,选择R Markdown (.Rmd)选项 git添加,提交和推送 Netl
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-31
文件大小:108mb
提供者:
weixin_42099070