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搜索资源列表

  1. scRepertoire:单细胞免疫分析的工具包-源码

  2. 曲目 单细胞免疫分析的工具包 介绍 单细胞测序是免疫学和肿瘤学领域的一项新兴技术，它使研究人员能够将RNA定量和其他方式耦合在一起，例如在单个细胞水平上对免疫细胞受体进行谱分析。 已经创建了许多工作流程和软件包来处理和分析单细胞转录组数据。 这些程序包使用户可以利用在基于单细胞的实验中生成的数据的广阔维度，并将数据提炼成新颖的见解。 与转录组领域不同，缺少允许单细胞免疫受体分析的软件选项。 为了使用户能够轻松地将RNA和免疫分布图结合起来，scRepertoire能够处理从10倍基因组学Chro

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  1. bioinf-commons:Kotlin中的生物信息学图书馆-源码

  2. 生物常见病 生物信息学图书馆。 内容 org.jetbrains.bio.dataframe像org.jetbrains.bio.dataframe大熊猫 org.jetbrains.bio.experiment命名计算-实验和资源配置 org.jetbrains.bio.genome用于基因组，序列，基因，本体等的API。 containers -基因组位置集API coverage -基因组覆盖率API，配对/单端，片段大小估计 data -描述任何种类的数据集资源，包括重复数据 for

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  1. Physalia_ML-源码

  2. Physalia_ML 生物学家的机器学习，动手入门 授课教师： Pietro Franceschi，Filippo Biscarini 提要使用现代定量技术表征复杂现象是几乎每个研究领域的标准方法。 生物学也不例外，并且在生命科学的方方面面都广泛使用多组学技术（代谢组学，转录组学，基因组学和蛋白质组学）。 最终的多元数据集非常复杂，需要应用高级数据分析方法来优化检索到的信息。 对于相对大规模的研究，机器学习是补充经典多元统计方法的有效工具。 本课程的目的是突出这些数据分析方法在生物学研究中

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  1. MQU_EvoGenomics:MQU进化基因组学项目的脚本-源码

  2. MQU_EvoGenomics MQU进化基因组学项目的脚本

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    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：36kb
    • 提供者：weixin_42157556

  1. computational-genomics:天普大学的计算基因组学课程-Jody Hey教授-源码

  2. 计算基因组学 天普大学的计算基因组学课程-Jody Hey教授 持有班上的所有模块（每周约1个）。

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    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：57mb
    • 提供者：weixin_42165018

  1. CoffeeProt-源码

  2. CoffeeProt：用于蛋白质组范围内系统遗传学相关性和功能富集的在线工具 基因组学，蛋白质组学和表型性状在遗传多样性人群中的整合是发现新型生物调节剂的有力方法。复杂数据量的不断增长要求各种科学家可以使用易于使用的新工具来发现和可视化功能相关的关联。为了满足此要求，我们开发了CoffeeProt，这是一种开放源代码工具，可以分析与蛋白质网络和表型性状相关的遗传变异。 CoffeeProt使用蛋白质组学数据进行相关网络分析，并注释蛋白质-蛋白质相互作用，亚细胞定位和药物关联。然后，它整合了遗传和

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    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：64mb
    • 提供者：weixin_42098251

  1. Bioinformatics-2:基因组测序-源码

  2. 生物信息学-2

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    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：32kb
    • 提供者：weixin_42157166

  1. PopulationGenomicsCourse:BiRC的人口基因组学课程-源码

  2. 2020年人口基因组学 描述 课程结束后，学员将对进行典型人群基因组研究所需的方法和应用有详细的了解。 参加者必须在课程结束时能够： 确定与种群基因组分析相关的实验平台。 应用常用的种群基因组方法。 解释常见种群基因组方法背后的理论。 反思种群基因组方法的优势和局限性。 解释和分析总体基因组推论的结果。 根据数据制定人口遗传学假设 该课程介绍了人口基因组学中的关键概念，从生成种群遗传数据集到最常见的种群遗传分析和关联研究。 本课程的第一部分着重于群体遗传数据集的生成。 第二部分介绍

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    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：19mb
    • 提供者：weixin_42105816

  1. BIS15L_Project_Group11:Bis 15L遗传学和基因组学项目-源码

  2. BIS15L_Project_Group11 Bis 15L遗传学和基因组学项目

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    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：47mb
    • 提供者：weixin_42131790

  1. phylo-seq-cap：使用新型基因组测序平台的系统信息学和种群基因组学生物信息学流水线-源码

  2. 使用有针对性的序列捕获来识别杨树和柳树之间的进化关系 该存储库包含用于创建我设计的新型基因分型平台的脚本和分析笔记本，其实现在我即将发表的论文《针对柳柳科的系统发育和种群基因组学的靶向序列捕获阵列》中有所报道，。 内容 ：此文件 ：详细介绍Jupyter笔记本格式手稿中报告的分析的笔记本 ：用于靶标捕获的探针序列，以及HybPiper用于基因序列组装的靶标参考文件 ：我编写的Python脚本，用于设计序列捕获数组并分析结果数据 通过有针对性的序列捕获获得的原始阅读数据将在手稿被接受出版后

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  1. 基因组基因组学课程-源码

  2. 基因组基因组学课程 欢迎来到我的GitHub存储库！

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    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：28mb
    • 提供者：weixin_42099530

  1. BioinfinvRepro：可重现的生物信息学简介-源码

  2. 介绍可再生的亲和力基因组生物学信息 墨西哥国立自治大学墨西哥分校医学与医学研究中心创世记。 说明书： 德拉Alicia Mastretta Yanes博士CatedráticaCONACYT-CONABIO， 德拉Camille Truong博士。 墨西哥国立自治研究所， 维罗尼卡·雷耶斯·加林多·埃斯图安特·科拉多 里卡多韦尔杜戈萨尔加多博士，博士PROFESOR Asistente，Programa德遗传学Humana公司，洲际弹道导弹，Facultad德MEDICINA，U.

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    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：49mb
    • 提供者：weixin_42157188

  1. 宏基因组活性书-源码

  2. 元基因组活动书 此回购旨在用作入门级元基因组学学习者或教师的资源。 对于宏基因组学领域的新手，这些活动以非常低技术的，对初学者友好的风格传达了基础知识。 通过消除编码和软件使用的压力，宏基因组学工作流背后的广泛思想可以更轻松地传达，这为学习者提供了从知识能力的角度寻求随附软件工具的空间，而不是被太多的新事物淹没。 这种方法还基于这样的思想：人们以许多不同的方式学习，并且多种信息传递模式可以增强理解。 和使用了类似的方法来开发宏宏的基因组学教学工具，尽管很遗憾，他们的创作已不再可用。 可以单独打

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  1. longev-mgen：“长寿的元基因组学”项目-源码

  2. 从元基因组组装的鼠尾草科基因组表明小鼠对阿卡波糖治疗产生差异React的遗传驱动力 用于复制分析和手稿的脚本和元数据。

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    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：639kb
    • 提供者：weixin_42128015

  1. mgkit：MGKit：元基因组学框架-源码

  2. MGKit：元基因组学框架 该库的目的是提供一系列有用的模块和软件包，以使构建宏宏基因组学或任何种类的生物信息学分析的自定义管道变得更加容易。 它在生物信息学中集成了其他知名的python库，例如 ， ， 和 。 可从获得文档。可以从获得文档中使用的数据和脚本。 讨论邮件列表可从。 使用MGKit的论文 Rubino，F.，Carberry，C.，M Waters，S.，Kenny，D.，McCabe，MS，＆Creevey，CJ（2017年）。 不同的功能同工型驱动小生境专业化，以获取

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    • 发布日期：2021-02-08
    • 文件大小：11mb
    • 提供者：weixin_42125770

  1. genomics-r-intro：R和RStudio的基因组学简介-源码

  2. R和RStudio基因组学简介 发展中的教训。 如何贡献？ 该存储库使用GitHub Actions构建和部署课程。 应针对main分支机构做出贡献和拉取请求。 合并您的文稿后，Travis将负责使用R将Rmd文件处理为markdown文件，并将它们推入gh-branch ，GitHub将其用作本课程网站的服务。 个别情节文件位于_episodes_rmd文件夹中。

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  1. GenomeGraphs.jl：Julia的现代基因组学框架-源码

  2. GenomeGraphs.jl：Julia的现代基因组学框架

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  1. sc2-illumina-pipeline：CZ Biohub上用于SARS-CoV-2测序的生物信息学管道-源码

  2. SARS-CoV-2共识基因组管道 该管道从fastq文件生成共识SARS-CoV-2基因组。 我们将其用于以下类型的测序数据： 丰富的SARS-CoV-2读本的元基因组测序（ ）。 基于扩增子的短读测序（使用ARTIC v3协议）。 典型用法 为了从阅读中生成共有基因组： nextflow run czbiohub/sc2-illumina-pipeline -profile artic,docker \ --reads '[s3://]path/to/reads/*_R{1,

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    • 发布日期：2021-01-31
    • 文件大小：10mb
    • 提供者：weixin_42125192

  1. 基因组工具：GenomeTools基因组分析系统-源码

  2. Genome工具 GenomeTools基因组分析系统是一个免费的生物信息学工具集合（在基因组信息学领域），组合成一个名为gt二进制文件。 它基于一个名为libgenometools的C库，该库包含用于高效，便捷地实现序列和注释处理软件的各种类。 如果您对基因预测感兴趣，请查看 。 GenomeTools设计为可在每个POSIX兼容的UNIX系统上运行，例如Linux，Mac OS X和OpenBSD。 Debian（正在测试）和Ubuntu（正在运行rar和更高版本）的用户只需使用apt就

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    • 发布日期：2021-01-30
    • 文件大小：15mb
    • 提供者：weixin_42112658

  1. 难题：BEDOPS：高性能基因组特征操作-源码

  2. BEDOPS v2.4.39：高性能基因组特征操作 关于 BEDOPS v2.4.39是一套用于解决基因组研究中提出的常见问题的工具，主要涉及数据集之间的重叠和邻近关系。 它旨在具有可扩展性和灵活性，以促进高效，准确地分析和管理大规模基因组数据。 BEDOPS v2.4.39文档的部分概述了工具包，功能和性能增强。 表提供了所有应用程序和脚本的文档。 资料下载 Linux Mac OS X 源代码 二进制文件 Linux主机的 安装程序包 Mac OS X主机的 （tar.gz） （zi

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-30
    • 文件大小：21mb
    • 提供者：weixin_42144199
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