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资源分类
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引入遗传退火的频率分配算法
一个很好的基于遗传退火算法的频率分配思路,仅供共同研究参考
所属分类:
其它
发布日期:2009-05-12
文件大小:90kb
提供者:
vikingland
phylip进化分析工具
PHYLIP软件是一个免费的集成的进化分析工具,有华盛顿大学遗传学系Joseph felsenstein 编写,1980年首次释放,目前已经升级到3.6.7版本。PHYLIP包含了35个程序,这些程序基本上囊括了系统发生分析方面的所有方面,并且可以在很多平台上运行。包括分子程序组、距离程序组、基因频率组、连续字符组、不连续字符组和进化树绘制组。
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-12-16
文件大小:1mb
提供者:
bbc1172000
philip 3.68
PHYLIP是由Joseph Felsenstein开发的多平台操作系统常用系统发生推论软件(Phylogeny Inference Package),具有DNA和蛋白序列分析、限制性酶切位点分析、距离矩阵和基因频率、进化树绘制,可以通过许多选项精确控制分析过程。
所属分类:
专业指导
发布日期:2010-12-10
文件大小:3mb
提供者:
sand0811
DAMBE软件可以用于生物学分析
DAMBE软件,系统进化有关软件和使用概述:DAMBEata Analysis in Molecular Biology and Evolution这是一个整合的软件包用于检索、组织、处理、排列和分析分子序列数据数。DAMBE也可用于等位基因频率数据库
所属分类:
医疗
发布日期:2014-03-20
文件大小:10mb
提供者:
u014238221
小波变换提取基音频率 Matlab
Matlab代码:在小波变换后用近似系数的峰值获取该帧的基音频率
所属分类:
其它
发布日期:2014-10-15
文件大小:1kb
提供者:
q02132
统计基因频率
统计基因频率.R语言
所属分类:
其它
发布日期:2015-12-09
文件大小:405byte
提供者:
qq_29643379
语音信号处理-基音频率估计
(1) 掌握语音信号的基音周期提取的方法,实现其中一种基频提取方法; (2) 学会用自相关法进行语音信号的基因检测;
所属分类:
专业指导
发布日期:2018-03-13
文件大小:68kb
提供者:
qq_25952133
mlrC基因异源表达系统的构建
mlrC基因异源表达系统的构建,王瑞萍,李洁明,微囊藻毒素( Microcystins, MCs)是出现频率和危害最大的藻毒素,生物降解可有效去除MCs。Novosphingobium sp. THN1是从太湖分离出的MCs降解菌株,m
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-22
文件大小:595kb
提供者:
weixin_38602098
TCF7L2基因SNP rs11196218频率在糖尿病疾病谱中的变化
TCF7L2基因SNP rs11196218频率在糖尿病疾病谱中的变化,林健,李玉萍,目的 探讨TCF7L2基因SNP rs11196218基因型在糖尿病各种亚型中的分布特点,以期证明糖尿病是一个连续的疾病谱。 方法 用TaqMan和PCR-直接测序
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-08
文件大小:323kb
提供者:
weixin_38657115
焦磷酸测序技术检测SLCO1B1基因多态性方法的建立
焦磷酸测序技术检测SLCO1B1基因多态性方法的建立,万子睿,郭栋,目的 建立SLCO1B1 A388G和T521C单核苷酸多态位点的焦磷酸测序方法,分析中国健康人群中分布频率。方法 制备300例健康人外周血gDNA,应用PyroM
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-08
文件大小:315kb
提供者:
weixin_38745233
中国美利奴羊MHC-DRB1基因PCR-RFLP多态性分析
中国美利奴羊MHC-DRB1基因PCR-RFLP多态性分析,贾斌,,本研究应用巢式PCR-RFLP方法,对207只中国美利奴(新疆军垦型)羊的MHC-DRB1外显子2的遗传多态性进行检测,并对基因型频率和等位基因频率
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-18
文件大小:292kb
提供者:
weixin_38642369
3q27基因多态性与腰围的关系
3q27基因多态性与腰围的关系,付晓丽,刘莉,目的 探讨3q27基因三个SNPs位点多态性的频率分布及与中国汉族人群腹型肥胖的关系,为腹型肥胖的早诊断、早预防、早治疗提供理论依�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-05
文件大小:424kb
提供者:
weixin_38738983
猪SOCS1基因多态性分析
猪SOCS1基因多态性分析,韩小飞,牛步月,本研究选择SOCS1作为猪抗病育种候选基因,利用直接测序法寻找SOCS1基因多态性,并在*和长白猪群体中进行基因频率和多态信息含量�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-01
文件大小:475kb
提供者:
weixin_38698943
进食频率和多态性细胞色素P450 2A6活性对日本队列个体结直肠癌风险的影响
相对于结直肠癌风险,肉食,吸烟习惯和表型细胞色素P450 2A6变异之间的关系尚不清楚。 在这项研究中,分析了从不吸烟者和从不吸烟者的病例对照研究(299例和170例对照)中大肠癌风险,问卷调查的肉食消耗和通过基因分型的表型P450 2A6活性之间的关系。 每天食用总肉量≥1的从不吸烟者,观察到年龄和性别的Logistic回归调整后的显着优势比为4.42(95%置信区间为1.29-15.2),与之相比则为≤2每周可食用。 此外,在日本从不吸烟者中,大肠肿瘤的易感性取决于肉的摄入频率(趋势检验p
所属分类:
其它
发布日期:2020-06-03
文件大小:600kb
提供者:
weixin_38558054
FHIT,RASSF1A和RAR beta基因甲基化对中国人群非小细胞肺癌的联合作用
肿瘤抑制基因的表观遗传修饰涉及各种人类癌症。 异常启动子甲基化也被认为在肺癌的发展中起着至关重要的作用,但发病机理仍不清楚。 我们收集了112位受试者的数据,其中包括56位被诊断患有肺癌的患者和56位未患癌症的对照。 使用甲基化特异性聚合酶链React(PCR,MSP)评估所有样品中DNA的FHIT,RASSF1A和RAR-β基因的甲基化以及相应的基因甲基化状态。 结果表明,与对照组相比,肺癌中单独基因甲基化的总频率显着更高(33.9-85.7 vs 0%)(p 0.05)。 这些观察结果表明
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:412kb
提供者:
weixin_38723242
BAG_SNPs:使用基于SNP的野生物种种群的等位基因频率和遗传多样性估算种质库(BAG)样本量的脚本-源码
使用SNP和重采样数据集的种子/种质库中的等位基因频率和遗传多样性 使用等位基因频率和野生物种/种群的遗传多样性估算种质/种子库(BAG)中样本量的影响的脚本 番薯分三步走: 使用VCF计算野生物种/种群中的等位基因频率 使用野生物种/种群作为模型,使用VCF计算重采样数据集中的等位基因频率。 使用野生物种/种群作为使用GENIND的模型,计算重采样数据集中的遗传多样性。 Pilocarupus分五个步骤: 使用GENIND对象(空等位基因和等位基因> 50个副本)在自然种群和具有
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:24kb
提供者:
weixin_42116847
从基于临床单样本的PPI网络预测疾病基因
实验上鉴定疾病基因既耗时又昂贵,因此吸引人们的兴趣是开发用于预测疾病基因的计算方法。 现有的许多方法都可以通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络预测新的疾病基因。 然而,.PPI在单元的生命周期中不断变化,因此仅使用静态的.PPI网络可能会降低算法的性能。 在这项研究中,我们提出了一种基于从临床基于单个样本的PPI网络(dgCSN)中提取的中心特征来预测疾病基因的算法。 我们的dgCSN首先从通用静态PPI网络和每个病例样品的临床基因表达构建一个基于样品的网络,然后根据所有基于单个样品的网络中
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-02
文件大小:518kb
提供者:
weixin_38621565
HMMploidy:使用隐马尔可夫模型从基因型可能性和覆盖率计算倍性水平的工具-源码
HMM倍性:基于基因型和覆盖率的隐马尔可夫模型,用于推断倍性水平。 推断倍性水平,检测非整倍性和其他物质的工具。 计算其等位基因频率和基因型可能性,需要下载以下内容: python 3,带有gzip, numpy, scipy, statistics软件包 R,带有pracma, data.table, Rcpp, getopt包pracma, data.table, Rcpp, getopt samtools 多倍体数据模拟 概述:模拟多倍体生物并以mpileup.gz格式输出 simu
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-28
文件大小:51kb
提供者:
weixin_42127020
将丰富的背景知识用于基因命名实体的分类和识别
背景:基因命名实体的分类和识别是生物医学文献中文本挖掘的关键性初步步骤。 基于机器学习的方法已在这一领域获得了巨大成功。 在大多数最新系统中,精心设计的词汇功能(例如单词,n-gram和形态模式)已发挥了核心作用。 但是,这种类型的特征往往会导致特征空间中的极度稀疏。 结果,由于缺乏信息,训练数据中的词汇不足(OOV)术语无法很好地建模。 结果:我们提出了一个通用的基因命名框架,称为实体表示,称为特征耦合泛化(FCG)。 基本思想是在大量未标记数据中使用术语频率和高度指示性特征的共现信息来生成更
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:578kb
提供者:
weixin_38556205
autoLM:使用空间自校正的快速基因-环境关联测试-源码
自动LM 使用空间自校正的基因-环境关联测试 概括 autoLM确定等位基因频率与环境指标之间的相关性。 它将使用简单的线性回归来确定最强的GEA相关性。 如果包括遗传簇和种群坐标,autoLM将使用空间自相关和种群结构作为随机变量来预测GEA。 输入 有两个主要输入文件和一个可选文件(请参阅示例文件): 每个人群的等位基因频率,不包含标签格式:第一列是人群名称,其后是每个SNP的等位基因频率。 每个人口的环境变量的度量格式:行对应于人口,其顺序与文件1相同。不包括人口名称。 以下各栏是针
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:6kb
提供者:
weixin_42099302
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