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资源分类
搜索资源列表
rna小流程化
rna seq 流程
所属分类:
Perl
发布日期:2013-06-14
文件大小:4kb
提供者:
skenoy
小RNA 高通量测序数据分析方法
小RNA 高通量测序数据分析方法 NGS 非常好用 详细介绍了分析流程
所属分类:
其它
发布日期:2013-09-11
文件大小:1mb
提供者:
philipzhx
RNA研究方法
RNA研究方法为小罗伯特 法雷尔博士多年来从事RNA实验研究和关于RNA研究方法的教学推广。
所属分类:
教育
发布日期:2014-11-25
文件大小:24mb
提供者:
a0b1v0
基于双加权法的RNA-seq数据的标准化
基于双加权法的RNA-seq数据的标准化,吴小惠,赵闯,不同实验条件下高通量测序数据的标准化是整个高通量数据分析与处理的重要部分,是进行基因结构识别和差异表达分析的前提与基础,
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-26
文件大小:394kb
提供者:
weixin_38695159
家蚕BmAGO2的克隆、表达分析及其结合RNA的分离与 初步鉴定
家蚕BmAGO2的克隆、表达分析及其结合RNA的分离与 初步鉴定,洪叶挺,高珍,Argonaute(AGO)蛋白是miRNA和RNAi途径的关键组分,能结合miRNA和siRNA小分子及其靶基因mRNA,介导miRNA和siRNA对靶基因的表达调控。同时通过免
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-20
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38701312
PPARδ基因RNA干扰慢病毒载体的构建及稳定干扰结肠癌细胞株KM12C的建立
PPARδ基因RNA干扰慢病毒载体的构建及稳定干扰结肠癌细胞株KM12C的建立,蒋小,杨烈,大肠癌是常见的恶性肿瘤,其发病率和病死率正逐年递增。过氧化物酶体增殖因子活化受体δ(peroxisome pro1iferator2activated receptorδ, PPARδ) 是�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-08
文件大小:498kb
提供者:
weixin_38642735
组分矢量方法与小亚基核糖体RNA方法构建进化树的对比
组分矢量方法与小亚基核糖体RNA方法构建进化树的对比,叶远浓,郭锋彪,生物进化研究是生物学的一个重要研究分支,随着生物技术发展和生物序列数据库数据的快速增长,出现了许多推断生物之间进化关系的
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-07
文件大小:618kb
提供者:
weixin_38723027
绒山羊70天胎儿皮肤小分子RNA文库构建及miRNA鉴定
绒山羊70天胎儿皮肤小分子RNA文库构建及miRNA鉴定,尹俊,张靓,miRNA是一类21-23个核苷酸的单链小分子RNA,最近发现miRNA对哺乳动物毛囊的发育和维持具有重要作用。为了研究miRNA在绒山羊毛囊发育中的作
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-06
文件大小:415kb
提供者:
weixin_38725450
双链RNA结合蛋白TRBP、PRKRA在miRNA成熟过程中的调控作用
双链RNA结合蛋白TRBP、PRKRA在miRNA成熟过程中的调控作用,苏位君,李帅,miRNA是一类具有重要调控功能的小分子非编码RNA,广泛参与发育、细胞增殖、凋亡、周期等多种重要生物学过程的调节。Dicer是miRNA加工成
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-03
文件大小:385kb
提供者:
weixin_38638647
小分子microRNA及其生物学特征
小分子microRNA及其生物学特征,王春梅,李庆章,microRNAs(miRNAs)是机体内源性表达的一类长20~24nt的非编码RNA调控因子,在动植物细胞中导致转录后基因沉默。近来发现miRNAs家族成员众�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-25
文件大小:427kb
提供者:
weixin_38636655
微RNA分析方法及在肿瘤诊断和治疗中的应用
微RNA分析方法及在肿瘤诊断和治疗中的应用,屠蕴秋,蔡称心,微RNA(miRNAs)是一类含有19-23个碱基的内源性非编码小分子RNA,对基因表达有调控作用。miRNA在细胞分化、增殖、死亡和哺乳动物细胞生长�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-07
文件大小:537kb
提供者:
weixin_38611508
RNA干扰对血管内皮生长因子在人宫颈癌细胞系Hela细胞中表达及细胞增殖的影响
RNA干扰对血管内皮生长因子在人宫颈癌细胞系Hela细胞中表达及细胞增殖的影响,刘素梅,赵淑萍,目的 探讨血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)的小分子干扰RNA(siRNA)对培养的人宫颈癌Hela细胞增殖的影响,检测VEGF基�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-06
文件大小:705kb
提供者:
weixin_38635323
利用小RNA深度测序鉴定锦紫苏类病毒
利用小RNA深度测序鉴定锦紫苏类病毒,齐水水,姜冬梅,类病毒是一类可以侵染高等植物的特殊病原体,在特定的宿主中可以影响其正常的生理、生化功能和生长发育过程,并可以引起植物发病
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-02
文件大小:731kb
提供者:
weixin_38726441
阳离子脂质体悬浮悬浮液通过逆转转染评估小干扰RNA进入细胞。
通过小干扰RNA(siRNA)成功实现基因沉默,需要有效地将siRNA吸收到靶细胞中。 对于使用阳离子脂质体的siRNA体外转染,目前使用两种类型的转染方法:常规(正向; Fw)和反向(Rev)转染。 在这里,为了研究使用阳离子脂质体的有效siRNA转染方法,我们比较了Fw-转染和Rev-转染方法与各种类型的阳离子脂质体之间siRNA的转染效率。 在Fw转染中,将siRNA /阳离子脂质体复合物(siRNA脂质复合物)添加到预铺板细胞中。 相反,通过将细胞与siRNA脂质复合物在悬浮液中共孵育来
所属分类:
其它
发布日期:2020-06-05
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38610052
超灵敏生物传感器应用于识别RNA型病毒
美国纽约大学理工学院的科研人员制成了超灵敏的生物传感器,能够识别出溶液中最小的单个RNA型病毒(核酸为RNA的一类病毒总称为RNA型病毒)颗粒。
所属分类:
其它
发布日期:2020-10-18
文件大小:53kb
提供者:
weixin_38631225
RNA-seq、FPKM和Cuffdiff
RNA-seq RNA-seq即转录组测序技术,是将细胞内mRNA,nonconding-RNA等RNA或其中一些提取出来利用高通量测序技术进行测序和分析的技术,RNA-seq分析的主要目的是分析RNA对应基因的表达量。 RNA-seq的主要步骤如下:分离RNA——将RNA打断成小片段——RNA反转录为DNA,此后测序手段同DNA测序。 更详细步骤可参考: https://www.jianshu.com/p/d09e624efcab 前文提到RNA-seq的主要目的是得到RNA对应基因的表达丰度
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-06
文件大小:439kb
提供者:
weixin_38741966
bcbio-nextgen:经过验证的,可扩展的,社区开发的变异调用,RNA-seq和小RNA分析-源码
经过验证的,可扩展的,社区开发的变异调用,RNA序列和小RNA分析。 您编写一个高级配置文件,指定您的输入和分析参数。 此输入驱动并行运行,以处理分布式执行,幂等处理重新启动和安全的事务处理步骤。 bcbio提供了一个共享的社区资源,用于处理测序分析的数据处理部分,从而为研究人员提供了更多时间专注于下游生物学。 特征 社区发展:我们欢迎贡献者的目标是克服生物学,算法和计算方面的挑战,这些挑战是在快速变化的研究领域中从事复杂管道开发的个体开发人员所面临的挑战。 有关bcbio-nextgen部署的
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:16mb
提供者:
weixin_42123296
尺寸:用于小RNA序列处理的Nextflow DSL2管线-源码
缩小 用于小RNA序列处理的Nextflow DSL2管线
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:9mb
提供者:
weixin_42131342
tsRFinder:一种用于tRNA衍生的小RNA注释的工具-源码
tsRFinder:一种用于tRNA衍生的小RNA注释的工具
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:2mb
提供者:
weixin_42170790
smallRNA-polymRNA:小RNA和多核糖体测序数据的处理和分析-源码
smallRNA-多核糖体序列 用于处理和分析小RNA和多核糖体测序数据的脚本。 使用WBcel235进行注释。 依存关系 fastQC(v0.11.9) cutadapt(v2.10) 领结2(v2.3.4.3) samtools(v1.11) miRDeep2(v2.0.1.2) FeatureCounts(Subread,v2.0.0) edgeR(v3.11) 生物基质(v2.46.0) HISAT2(v2.10) 管道 小RNA序列 秀丽隐杆线虫基因组注释: C.ele
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-29
文件大小:8mb
提供者:
weixin_42117037
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