序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序) 序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序) 序列比对打分矩阵C++(实验报告+源程序)

序列比对打分矩阵_(实验报告+源程序)C++

该代码是通过perl导入打分矩阵BLOSUM62对比对的序列进行打分,由于在网上没有看到用perl写过这个程序，自己就写了一个，程序并不复杂，第一次上传，求顶！

通过编程实现课程中介绍的全局比对和局部比对的动态规划算法，并对“data.txt”中的2 条序列（每行代表1 条序列）进行测试，打分矩阵使用BLOSUM62 矩阵（BLOSUM62.txt）。

任选一种编程语言，设计一个双序列全局比对的程序。要求： 1） 输入两条蛋白质序列，输出比对结果例如： Alignment Score: 12345 E E E E E K K K K K A A A A A F F F E E E E E – – – – – B B B B B F F F 2） 使用BLOSUM62矩阵来对序列中氨基酸符号的match和mismatch打分。 3） 使用动态规划的方法（Needleman-Wunsch算法）。 4） 计算空位（gap）的罚分时，使用仿射空位罚分策