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序列比对算法综述(有兴趣的看看)
介绍序列比对算法,将序列比对中的问题提出,有兴趣的看看
所属分类:
其它
发布日期:2009-06-02
文件大小:137216
提供者:
hale007
RNA序列比对算法研究
RNA序列比对算法RNA序列比对算法研究研究RNA序列比对算法研究
所属分类:
其它
发布日期:2009-07-25
文件大小:3145728
提供者:
fhqdddddd
序列比对算法使用动态规划化方法实现序列比对算法
使用动态规划化方法实现序列比对算法,有详细注解
所属分类:
其它
发布日期:2009-09-17
文件大小:725
提供者:
NDSC_8002
一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf
一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf
所属分类:
其它
发布日期:2010-02-22
文件大小:288768
提供者:
xgod_cn
生物信息多序列比对clustal
介绍多序列比对工具clustalx *多序列比对的意义 *多序列比对的方法 *自动多序列比对的算法 *Clustalx的使用 *实例分析
所属分类:
其它
发布日期:2010-12-21
文件大小:939008
提供者:
zhang3310028
生物序列比对算法研究现状与展望
序列比对是生物信息学研究的一个基本方法 ,寻求更快更灵敏的序列比对算法一直是生物信息学 研究的热点.本文给出了生物序列比对问题的定义 ,综述了目前常用的各类比对算法 ,并对每一类算法的 优缺点以及应用范围进行了分析 ,最后指出序列比对算法目前存在的问题以及未来的发展方向.
所属分类:
其它
发布日期:2010-12-26
文件大小:278528
提供者:
dongnanyouwo
基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf
基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf 基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf
所属分类:
其它
发布日期:2011-02-11
文件大小:261120
提供者:
qichanghong7368
生物DNA序列比对算法研究
生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!
所属分类:
其它
发布日期:2011-07-08
文件大小:242688
提供者:
iwillsucceed555
基于动态规划的快速序列比对算法
本文在分析介绍儿种相关动态规划算法的基础上,提出了一种基于动态规划的 快速序列比对算法UKKYA。
所属分类:
其它
发布日期:2008-08-28
文件大小:350208
提供者:
hihibin
生物序列比对
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究
所属分类:
C
发布日期:2018-04-26
文件大小:3145728
提供者:
qq_25342725
生物信息序列比对算法
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究
所属分类:
Java
发布日期:2018-04-27
文件大小:1048576
提供者:
qq_25342725
遗传算法模拟生物多序列比对之交叉算子优化
为优化生物多序列比对问题,降低计算难度,提高计算效率,采用遗传算法模拟多序列比对,构造了四种简单的交叉算子及三种后处理方式,分析交叉算子和交叉后处理方式对多序列比对结果的影响。通过实验比较,结果表明多行横向交叉的计算效果最好,后处理方式cross4to2能有效缩短计算时间,二者相结合能很大提高遗传算法的计算效率,从而达到优化多序列比对的目的.
所属分类:
其它
发布日期:2020-04-27
文件大小:1048576
提供者:
weixin_38621565
遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.
所属分类:
其它
发布日期:2020-04-24
文件大小:293888
提供者:
weixin_38672800
自适应蚁群算法在序列比对中的应用.zip
自适应蚁群算法摘要 :序列 比对是生物信息学的重要研究-rg。蚁群算法是一种新型的模拟进化算法,并被成功地应用于旅行商问题(TSP) 等组合优化问题中。该文将蚁群算法应用于序列比对,并提出基于 自适应调整信息素的改进算法。仿真结果表明这种新的 比对算法是有效的,而它的改进算法的效果更为理想。 关键词:蚁群算法;序列比对 ;信息素在序列比对中的应用
所属分类:
算法与数据结构
发布日期:2020-04-01
文件大小:186368
提供者:
zhidc
基于局部序列比对的漏洞挖掘技术研究
针对网络协议漏洞挖掘系统在网络协议格式分析过程中使用全局序列比对技术效率不高的问题,结合网络漏洞挖掘背景,对序列比对技术进行深入分析,提出了一种更为有效的基于局部序列比对算法的Fuzzing漏洞挖掘新方法。在获取网络协议格式分析的过程中,提高漏洞挖掘效率。仿真结果表明,该方法较全局序列比对方法在执行效率上具有较为明显的优势。
所属分类:
其它
发布日期:2020-10-16
文件大小:346112
提供者:
weixin_38668754
js DNA动态序列比对代码
Javascr ipt动态序列比对代码,随便 写着玩的,在网上见到用VC、VB写的比较多,这个算法以前在高中课本上见到过,我只是用Js写一下试试,或许还不是太准确。
所属分类:
其它
发布日期:2020-10-29
文件大小:29696
提供者:
weixin_38559992
基于多策略人工蜂群的多序列比对算法
多序列比对是生物信息学中最重要和挑战性的任务之一. 针对多序列比对是NP 完全组合优化问题, 引.入Tent 混沌初始化种群策略、不同蜂种的邻域搜索策略和锦标赛选择策略等, 提出了一种基于多策略人工蜂群.的多序列比对算法. 该算法应用Tent混沌初始化种群策略以使初始个体多样化和获取较好初始解; 其次针对不同.蜂种的特性设计不同的邻域搜索策略以平衡算法的全局探索与局部开发能力. 同时引入序列比对的蜜源编码方.法以适应多序列比对的离散性. 实验结果表明, 该算法鲁棒性较强, 能获取较好的比对性能和
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-23
文件大小:373760
提供者:
weixin_38659805
完整且精确的重复短序列比对算法
完整且精确的重复短序列比对算法
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-15
文件大小:715776
提供者:
weixin_38688097
基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法
基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:401408
提供者:
weixin_38628552
一种新颖的快速且高效存储的并行MLCS算法,用于长序列和大规模序列比对
通常可以将信息抽象为有限字母上的字符序列。 随着大数据时代的到来,来自各个应用领域(例如,生物序列)的序列的长度和大小不断增加,导致了经典的NP难题,即寻找多个序列的多个最长公共子序列(即MLCS问题在生物信息学,计算基因组学,模式识别等领域具有许多应用),成为研究热点并面临严峻挑战。 在本文中,我们首先揭示了基于主导点的MLCS算法很难应用于长序列和大规模序列比对。 为了克服它们的缺点,基于提出的问题解决模型和并行拓扑排序策略,我们提出了一种新颖的高效并行MLCS算法。 对随机序列和生物学序列
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-06
文件大小:655360
提供者:
weixin_38742453
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