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搜索资源列表

  1. 序列比对算法综述（有兴趣的看看）

  2. 介绍序列比对算法，将序列比对中的问题提出，有兴趣的看看

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2009-06-02
    • 文件大小：134kb
    • 提供者：hale007

  1. 序列比对算法使用动态规划化方法实现序列比对算法

  2. 使用动态规划化方法实现序列比对算法，有详细注解

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2009-09-17
    • 文件大小：725byte
    • 提供者：NDSC_8002

  1. 一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf

  2. 一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2010-02-22
    • 文件大小：282kb
    • 提供者：xgod_cn

  1. 生物信息多序列比对clustal

  2. 介绍多序列比对工具clustalx *多序列比对的意义 *多序列比对的方法 *自动多序列比对的算法 *Clustalx的使用 *实例分析

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2010-12-21
    • 文件大小：917kb
    • 提供者：zhang3310028

  1. 基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf

  2. 基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf 基于蚁群遗传算法的氨基酸序列比对.pdf

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2011-02-11
    • 文件大小：255kb
    • 提供者：qichanghong7368

  1. 生物DNA序列比对算法研究

  2. 生物DNA序列比对算法研究！！！生物DNA序列比对算法研究！！！生物DNA序列比对算法研究！！！

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2011-07-08
    • 文件大小：237kb
    • 提供者：iwillsucceed555

  1. 基于动态规划的快速序列比对算法

  2. 本文在分析介绍儿种相关动态规划算法的基础上，提出了一种基于动态规划的 快速序列比对算法UKKYA。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2008-08-28
    • 文件大小：342kb
    • 提供者：hihibin

  1. 生物序列比对

  2. 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究

  3. 所属分类：C

    • 发布日期：2018-04-26
    • 文件大小：3mb
    • 提供者：qq_25342725

  1. 生物信息序列比对算法

  2. 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2018-04-27
    • 文件大小：1mb
    • 提供者：qq_25342725

  1. 遗传算法模拟生物多序列比对之交叉算子优化

  2. 为优化生物多序列比对问题,降低计算难度,提高计算效率,采用遗传算法模拟多序列比对,构造了四种简单的交叉算子及三种后处理方式,分析交叉算子和交叉后处理方式对多序列比对结果的影响。通过实验比较,结果表明多行横向交叉的计算效果最好,后处理方式cross4to2能有效缩短计算时间,二者相结合能很大提高遗传算法的计算效率,从而达到优化多序列比对的目的.

  3. 所属分类：其它

  1. 遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进

  2. 针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-04-24
    • 文件大小：287kb
    • 提供者：weixin_38672800

  1. 自适应蚁群算法在序列比对中的应用.zip

  2. 自适应蚁群算法摘要 ：序列 比对是生物信息学的重要研究-rg。蚁群算法是一种新型的模拟进化算法，并被成功地应用于旅行商问题(TSP) 等组合优化问题中。该文将蚁群算法应用于序列比对，并提出基于 自适应调整信息素的改进算法。仿真结果表明这种新的 比对算法是有效的，而它的改进算法的效果更为理想。 关键词：蚁群算法；序列比对 ；信息素在序列比对中的应用

  3. 所属分类：算法与数据结构

    • 发布日期：2020-04-01
    • 文件大小：182kb
    • 提供者：zhidc

  1. js DNA动态序列比对代码

  2. Javascr ipt动态序列比对代码，随便 写着玩的，在网上见到用VC、VB写的比较多，这个算法以前在高中课本上见到过，我只是用Js写一下试试，或许还不是太准确。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-10-29
    • 文件大小：29kb
    • 提供者：weixin_38559992

  1. 基于多策略人工蜂群的多序列比对算法

  2. 多序列比对是生物信息学中最重要和挑战性的任务之一. 针对多序列比对是NP 完全组合优化问题, 引.入Tent 混沌初始化种群策略、不同蜂种的邻域搜索策略和锦标赛选择策略等, 提出了一种基于多策略人工蜂群.的多序列比对算法. 该算法应用Tent混沌初始化种群策略以使初始个体多样化和获取较好初始解; 其次针对不同.蜂种的特性设计不同的邻域搜索策略以平衡算法的全局探索与局部开发能力. 同时引入序列比对的蜜源编码方.法以适应多序列比对的离散性. 实验结果表明, 该算法鲁棒性较强, 能获取较好的比对性能和

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-23
    • 文件大小：365kb
    • 提供者：weixin_38659805

  1. 完整且精确的重复短序列比对算法

  2. 完整且精确的重复短序列比对算法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：699kb
    • 提供者：weixin_38688097

  1. 基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法

  2. 基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：392kb
    • 提供者：weixin_38628552

  1. 一种新颖的快速且高效存储的并行MLCS算法，用于长序列和大规模序列比对

  2. 通常可以将信息抽象为有限字母上的字符序列。 随着大数据时代的到来，来自各个应用领域（例如，生物序列）的序列的长度和大小不断增加，导致了经典的NP难题，即寻找多个序列的多个最长公共子序列（即MLCS问题在生物信息学，计算基因组学，模式识别等领域具有许多应用），成为研究热点并面临严峻挑战。 在本文中，我们首先揭示了基于主导点的MLCS算法很难应用于长序列和大规模序列比对。 为了克服它们的缺点，基于提出的问题解决模型和并行拓扑排序策略，我们提出了一种新颖的高效并行MLCS算法。 对随机序列和生物学序列

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：640kb
    • 提供者：weixin_38742453

  1. linnaeo：用于查看，分析和生成蛋白质序列比对的图-源码

  2. Linnaeo：一种蛋白质序列比较工具 Linnaeo是一个程序，旨在通过提供一种比较蛋白质序列的简便方法来帮助得出有关蛋白质的结构-功能关系的结论。 在您感兴趣的物种中，通常无法很好地理解一种生物体中被充分研究的蛋白质（也许是已知的结构，或者已经进行了很多酶学研究）。 进行比对可以帮助您找到与这些替代蛋白序列中表征的残基相当的残基，并根据保守程度的高低建议其他重要的残基。 因此，Linnaeo旨在允许您： 在文件夹中存储和组织要跟踪的蛋白质序列 使用MUSCLE算法从这些序列的不同组合动态

  3. 所属分类：其它

  1. museqa：使用混合并行计算的多序列比对器-源码

  2. 穆塞卡 Museqa，发音为moo-zee-kah ，是用于混合并行计算环境的多序列比对器。 动机 在生物信息学中，多种生物序列的整体比对至关重要。 这使生物学家能够了解许多不同物种之间的进化关系。 但是，对该问题的最佳解决方案在计算上是困难的，即，如果序列的数量或此类序列的大小任意大，则不能及时执行。 作为替代方案，已经出现了几种方法作为对该问题的启发式方法。 该项目的重点是在其三个单独的步骤中使用混合并行计算探索和实现渐进式比对启发法。 系统发育树生成； 最后是渐进式对齐本身。 该启发

  3. 所属分类：其它

  1. 基于多策略人工蜂群的多序列比对算法

  2. 多序列比对是生物信息学中最重要和最具挑战性的任务之一.基于多序列比对是NP 完全组合优化问题,引入Tent 混沌初始化种群策略、不同蜂种的邻域搜索策略和锦标赛选择策略等,提出一种基于多策略人工蜂群的多序列比对算法.该算法应用Tent混沌初始化种群策略以使初始个体多样化并获取较好初始解;针对不同蜂种的特性设计不同的邻域搜索策略以平衡算法的全局探索和局部开发能力.同时引入序列比对的蜜源编码方法以适应多序列比对的离散性.实验结果表明,所提出算法的鲁棒性较强,能获取较好的比对性能和生物特性.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-13
    • 文件大小：242kb
    • 提供者：weixin_38681646
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