弹光调制傅里叶变换光谱仪(PEM-FTS)的调制光程差是高速、正弦变化的，每秒可产生10万张干涉图。为了实现等时间采样干涉信号的快速、低误差光谱反演，三次样条插值算法、带有相位补偿的离散傅里叶变换(NDFT)算法和加速非均匀快速傅里叶变换算法(NUFFT)分别被应用到PEM-FTS的数据处理系统中。研究发现，对等时间采样弹光调制干涉数据进行光谱反演，加速NUFFT算法数据处理速度比较快，较相位补偿的NDFT算法高一个数量级，是三次样条插值后快速傅里叶变换算法的2倍，且采样点数越多此算法优点越突出

在弹光调制傅里叶变换光谱仪（PEM-FTS）中，由于调制光程差的非线性，不能直接采用快速傅里叶变换(FFT)进行反演光谱，且直接计算开销过大。首先在Matlab软件中用非均匀快速傅里叶变换算法（NUFFT）对PEM非等相位干涉信号进行了软件仿真，其次设计了以TMS320C6713高性能浮点数字信号处理器(DSP)芯片为核心的光谱信息处理系统，实现了硬件上的光谱实时处理。研究表明，算法对光谱反演具有速度快、精度高等优点，1024点光谱反演的速度较直接运算的速度提高20多倍，反演精度可达0.78%。