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talking_2_computers:与与计算机交谈有关的所有事物。 包括我学到的东西,想法和有用的资源-源码
目录 学习时间表 学习了如何在R语言中使用ggplot2 去了德国的微生物学讲习班 阅读生物学家实用计算向我介绍了Linux,bash,正则表达式和Python 选择Vim作为我的文本编辑器 使用Python学习的基础知识(变量,条件,循环) 二手的学习Python的困难之路 了解有关Linux和bash的更多信息 开始使用Github 在RU(2021年秋季)成为CAREERS Cyberteam的一部分开始学习高性能计算 参加了CyVerse容器研讨会(2021年秋季) 向我介绍了
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其它
发布日期:2021-03-26
文件大小:2kb
提供者:
weixin_42133918
VAP-Microbiology-Shiny-App-源码
VAP-微生物学-闪亮的应用程序 该代码构建并部署了为VAP组构建的闪亮应用程序,以整合临床和微生物因素,以进行特定主题的探索。该应用程序最初于2019年构建和部署,现在位于此处: :
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:5kb
提供者:
weixin_42131439
TamayoLeivaJ-源码
欢迎,我是哈维尔! 数据科学,数据可视化和微生物生态 我是博士微生物学的学生。 微生物生态学家和推动数据科学家。 数据爱好者,喜欢分析,建模和可视化,以创建和共享知识和价值。 我一直很想学习一些新的东西,以及通过动态工具分享它的方法。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:44kb
提供者:
weixin_42132352
MicrobiomeInformaticsWebinarWeek3:OSU CoMS网络研讨会的第3周-源码
微生物学信息网络研讨会第3周
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:1kb
提供者:
weixin_42161450
actiontest-源码
#GuideMaker GuideMaker:针对任何小型基因组中的任何CRISPR-Cas系统的全球设计指南RNA 某些事情没有定下行动 作者 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Lidimarie Trujillo 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Ravin Poudel博士 佛罗里达大学微生物学和细胞科学系Christopher Reisch博士 美国农业部农业研究服务部Adam R. Rivers博士 介绍 安装 GuideMaker可以从以下位置安装: Github存储库: :
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:15mb
提供者:
weixin_42132056
BIS15W2021_aweidner-源码
我的BIS 15L储存库 欢迎! 这是我所有BIS15L文件以及任何其他附加代码的存储库。 联络资料 安东尼·魏德纳 现任大二学生 微生物学专业,数学专业 谢谢你!
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:40mb
提供者:
weixin_42181693
P-MFC:QIIME2和R脚本,16S排序管线和分析-源码
P-MFC v 0.1 Gene Drendel博士项目分析,应用和环境微生物学小组LTU的生物信息脚本存储和版本控制。 初始脚本上传涵盖了HPC和R数据的准备,处理和分析,如下所示。 HPC脚本 基本脚本文件夹包含Daniel Rice的原始脚本模板,以及修改后的工作基础脚本,此后所有更改都已从该模板中进行。 盖子: 基本的HPC设置命令 原始测序数据导入 使用QIIME2进行处理 主要输出是: 分类表 OTU / ASV表 系统发育树 R脚本 Base scr ipt文件夹包含Jen
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:54kb
提供者:
weixin_42148975
Species_specific_differences_in_microbiomes-源码
c壳藻类藻类微生物群和有机物分泌物中的物种特异性差异影响浮游生物群落 作者:Zachary A. Quinlan,Raphael Ritson-Williams,Brenna J. Carroll,Craig A. Carlson,Craig E. Nelson 杂志:水生微生物学前沿 链接: : DOI:10.3389 / fmicb.2019.02397 资金: 这项研究得到了美国国家科学基金会授予CEN的OCE-1538393和CAC的OCE-1538428的支持。 本文的部分资金来
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:638kb
提供者:
weixin_42133861
狂犬病碎片-源码
狂犬病碎片 数据和分析的手稿脚本: 草地片段化和温度对牛狂犬病突发的协同效应 作者:BottoNuñez,Germán1,2,3 Becker,Daniel J. 4 Lawrence,Rick L. 5 Plowright,Raina K. 1 蒙大拿州立大学微生物学和免疫学系。 美国博兹曼MT 59717 República大学,梅迪西纳学院,MétodosCuantitativos部门。 蒙得维的亚,11800年,乌拉圭。 乌拉圭穆尔西拉戈斯保守党纲领。 西班牙国家自然博物馆,乌拉圭
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:12mb
提供者:
weixin_42131628
IM_webtool-dev:使用RShiny开发集成微生物学网络工具-源码
IM_webtool-dev 使用RShiny开发集成微生物学Web工具
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:226kb
提供者:
weixin_42136477
DNA提取方法比较-源码
标题为“两种广泛使用的DNA提取方法的比较”的文章的脚本 DOI: : 本文由微生物学方法杂志于2019年2月发布 接触 埃里克·马特乌斯·巴罗斯(Erick Mateus-Barros): 雨果· Hugo : 概述 在本手稿中,我们比较了水生微生物生态学中两种最常用的环境DNA提取方法(苯酚:氯仿和PowerSoil DNA分离试剂盒),以确定这两种方法是否可产生用于社区生态学分析目的的比较结果。 我们发现,尽管OTU的数量很少,但差异很大,但它们对社区有重大影响,并且这两种提取方
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其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:5kb
提供者:
weixin_42125867
生物实验室:微生物学中的计算机视觉-源码
正在施工:construction:!! ; 状态:20%; 预计完成时间:2021年3月下旬 内容: 1. Overview 2. What is antibiogram 3. Build Custom Datasets 4. Explore the Data 5. Baseline Model 6. Mask RCNN 7. Vision Transformer 8. Inference 微生物学中的计算机视觉 用Detectron2检测抗菌盘和抑制区 检测,测量和分类抗菌素。 具有合成图
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其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:297kb
提供者:
weixin_42140846
溶源性汤:Rust中细胞自动机的底物-源码
Rust中细胞自动机的底物。 以微生物学使用的命名。 也可以看一下安吉丽娜·范妮·黑塞(Angelina Fanny Hesse);)下层的网格是环形的,即坐标值/邻居环绕。 该代码在MIT / Apache 2.0许可下具有双重许可。 例子 以网格形式检索值: cargo run --example retrieval 规则30的执行: cargo run --example rule30 -规则30 cargo run --example rule30 特征 仅死活 为二进制(仅)单元状态
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其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:14kb
提供者:
weixin_42103587
微生物学-源码
微生物学
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-13
文件大小:7mb
提供者:
weixin_42134143
pioreactor:用于负担得起,可扩展和可扩展的生物React器的硬件和软件-源码
Pioreactor是一个开放源代码,可负担且可扩展的生物React器平台。 目的是使生物学家,教育者,DIY工作者,生物黑客和发烧友能够可靠地控制和研究微生物。 我们希望增强下一代构建者的能力,类似于RaspberryPi对我们的想象力的影响(实际上,我们硬件的核心是RaspberryPi)。 但是,考虑到的建设者是那些希望使用生物学或计算机科学或两者来实现目标的人。 对于研究而言,价格合理的价格点使Pioreactor车队能够研究大型实验空间。 对于教育者和学生来说,Pioreactor是
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-13
文件大小:90kb
提供者:
weixin_42111465
Maribacter-源码
“来自巴塔哥尼亚大陆架的海藻杆菌62-1中的CAZymes :与相关黄细菌和共生Alteromonas菌株相比的基因组学和生理学” 脚本和数据可重现Wolter等人的分析和数据。 “在巴塔哥尼亚架子上的海藻杆菌62-1中的CAZymes :与相关的黄细菌和共生Alteromonas菌株相比的基因组学和生理学”在《微生物学前沿》( )。 回购包含和,包括带以补充ENA进行中的沉积。
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其它
发布日期:2021-03-28
文件大小:22mb
提供者:
weixin_42107561