Z-BRAIN注册和细分 在此存储库中，我们建立了一个管道，用于对斑马鱼幼虫大脑中神经活动的体积神经影像数据进行配准和分段。 概述 这项工作的想法是，首先将一幅体积概要图像注册到幼虫斑马鱼的大脑，并放入一个共同的参考图集。 在第二步中，使用描述此配准（特别是它的逆配）的转换来映射参考图集中定义的大脑区域，从而对数据进行分割。 作为常见的参考图集，我们使用Z-BRAIN图集，该图集是由哈佛大学的Florian Engert周围的小组创建的，此后已作为斑马鱼斑马鱼的神经解剖学特征图集在斑马鱼社区中

斑马鱼1

// scenery // Java虚拟机上的体积和几何数据的灵活VR可视化 / 上与科学家一起研究果蝇的显微显微镜数据集/斑马鱼头部脉管系统的渲染/ / VR与显微镜数据实时交互 概要 风景是一个场景绘制和渲染库。 它使您可以基于网格数据快速创建高质量的3D可视化效果。 风光同时包含OpenGL 4.1和Vulkan渲染器。 可以使用YAML文件配置两个渲染器的渲染管道，因此可以轻松地在例如和以及之间进行切换。 渲染管道可以即时切换。 两种渲染器均支持通过对HTC Vive或Oculus