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paper-helper-bernat-2021:从10.1016j.immuni.2020.12.018收集的序列和元数据-源码
伯纳特2021年的数据收集 一些脚本可汇总抗体序列和来自以下位置的元数据: 内斯托(Néstor)等人的瓦兹奎·伯纳特(VázquezBernat)。恒河猴和食蟹猕猴免疫球蛋白重链基因分型产生了生殖系VDJ等位基因的综合数据库。免疫,第54卷,第2期,355-366.e4 最终的组合输出在。 数据源 最终等位基因序列,直接从来源获得: : GenBank登录范围,用于最终等位基因序列: MT561887-MT563069 MT643213-MT643227 MT672244-MT6
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42144086
Macaque-transcriptome-源码
猕猴转录组 该存储库包含所有用于生成结果的脚本和管道,其标题为“全长猕猴基因模型揭示了灵长类动物中多腺苷酸介导的转录组进化”。 transcr iptomeProject.sh:此文件包含分析所有数据的所有步骤。所有使用的脚本均已上载并存储在/ scr ipts中。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:102kb
提供者:
weixin_42140710
psort:P-sort是具有直观GUI的基于Python的开源跨平台软件。它旨在应对小脑神经生理学的挑战,特别是对小脑浦肯野细胞进行分选-源码
P-sort:小脑神经生理学的开源软件 P-sort已在开发,并与华盛顿大学和贝勒医学院的同事合作开发。 请参阅我们的论文以获取更多信息。 Sedaghat-Nejad E.,Fakharian MA,Pi J.,Hage P.,Kojima Y.,Soetedjo R.,Ohmae Sh。,Medina JF和Shadmehr R.(2021年)。 P-sort:小脑神经生理学的开源软件。 bioRxiv 2021.03.16.435644。 表中的内容 介绍 小脑浦肯野细胞(P细胞)的电生
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42160425
SignalPropagation:神经信号传播-源码
神经信号传播框架 这篇文章包含使用以下内容的大规模神经网络(非人工)仿真(合成) 射击率模型 加息率模型 所有模拟都是通过Brian2 python模块( )进行的。 可以在 (数据库部分)中获得猕猴的解剖学连接性(已纳入我们的模拟中)。 另外,这里以Excel格式提供:( ) 解剖学连通性根据标记神经元的分数定义为 FLN_ {B-to-A}是(从区域B投射到区域A的#个神经元)与(从所有区域投射到区域A的总#个神经元)的比率。 我们旨在在灵长类皮层的大规模电路模型中复制区域间平衡放
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:14kb
提供者:
weixin_42107491
SF_diversity:空间频率分集项目-源码
SF_多样性 空间频率分集项目 这是用SF混合项目用Python编写的所有代码。 该模型主要基于Goris,Simoncelli,Movshon(2015)中的模型。 (猕猴视觉皮层调节多样性的起源和功能;神经元) 代码以以下方式组织:在每个子目录(例如... / LGN /)中,我们具有与对应于该目录的特定实验相关的结构,图形和代码。 在这个主目录(SF_diversity /)中,我们具有用于运行分析的代码和包装函数(包装实验特定的代码)(自12.07.18起),致力于使此通用分支更加强大
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-28
文件大小:214mb
提供者:
weixin_42131790
Launchpad猕猴:Capstone项目-Launchpad猕猴-源码
短尾猿 Capstone项目-启动板猕猴
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-28
文件大小:2gb
提供者:
weixin_42160252
AFIDS_macaca-源码
AFIDS:猕猴 AFIDs协议( )适用于猕猴。 有关人类受试者的原始协议位于 。 加入我们的频道 资源 AFID协议: : AFID手稿: ://dx.doi.org/10.1002/hbm.24693 Prime-RE: : RheMAP: : 开放数据集和资源 待办事项:添加RheMAP工作流程中使用的不同模板 macaque_25_model_MNI : , M. Mallar Chakravarty,Stephen Frey和D.Louis Collins。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:29mb
提供者:
weixin_42129300
猕猴-源码
猕猴
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-19
文件大小:345kb
提供者:
weixin_42131790
猕猴-源码
有关更多详细信息,请参见。 欢迎使用Macaca Utility 安装 选项1:Unity软件包管理器 将其添加到编辑器的manifest.json文件中,如下所示: { " dependencies " : { " com.macacagames.utility " : " https://github.com/MacacaGames/MacacaUtility.git#1.0.0 " , } } 您可以删除#1.0.0以使用最新版本(不稳定) 选项2:Gi
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-17
文件大小:929kb
提供者:
weixin_42108778
macaque-cnv-figs:与我们的猕猴CNV论文一起使用的可再现图形的数据和脚本-源码
恒河猴的拷贝数变异的起源和长期模式的数据,代码和图形 作者 格雷格·托马斯 关于 该存储库托管CNV调用和其他数据以及R脚本,以进行分析和可再现的图形生成。 引文 即将到来 内容 每个fig文件夹均包含用于在纸张中生成图形和预渲染图形的代码。 如果更改每个脚本顶部附近的color_plots变量,则大多数图形可以彩色或灰度生成。 这是每个文件夹的描述: 1. counts :此文件夹包含一个脚本,该脚本仅读取和报告日志文件中的CNV计数。 2. data :用于生成纸张图形的所有数据 bran
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:322mb
提供者:
weixin_42148975
CloudReg:CloudReg-源码
CloudReg CloudReg是用于在任意图像体积之间进行跨模态,非线性图像配准的工具。 总览 量化万亿级多模式人类和动物成像数据需要可扩展的分析工具。 我们开发了CloudReg,这是一种基于云的自动化,万亿级的图像分析管道,用于预处理和跨模型,带有伪像的体积数据集之间的非线性配准。 CloudReg是使用清除的小鼠和大鼠大脑光片显微镜图像开发的,但在将以下数据集注册到各自的图集时也很准确:体内人和离体猕猴磁共振成像,离体鼠脑显微计算机断层扫描。 我们广泛的文档(如下)可以使该工具能够用于
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-12
文件大小:81mb
提供者:
weixin_42150745
猕猴-源码
MacacárioBRUTE 竞争情报库。 刺槐 达多斯大街 格拉夫斯 Matemática 范式 串Juntamente com ocódigodeve haver um README.md dando uma brevedescriçãosobre o algoritmo
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:36kb
提供者:
weixin_42172204
macaca-cli:Macaca命令行界面-源码
猕猴 Macaca命令行界面 贡献者 该项目遵循git-contributor,该于Thu Mar 21 2019 17:29:56 GMT+0800自动更新。 分期付款 $ npm i macaca-cli -g 常用用法 现场样本和文档: 执照 MIT许可证(MIT)
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-30
文件大小:20kb
提供者:
weixin_42130862
paper-helper-ramesh-2017:从10.3389fimmu.2017.01407收集的序列和元数据-源码
Ramesh 2017的数据收集 用于将GenBank沉积的抗体序列和注释与纸张提供的信息(请参见下文)合并到单个CSV表和FASTA中的脚本,用于尽可能多的等位基因。 有关最终输出,请参见和 (此处所有其他都是实现细节)。 CSV文件包含适用于基因组,CDS和AA序列的单独列,而FASTA文件包含CDS序列。 注意:CSV文件仍然缺少一些信息,并且与我在此处无法解决的论文相比,显示出一些小的不一致之处。 如果发现任何问题,我将在此处进行更新以解决这些问题。 Ramesh A,Darko S,
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-31
文件大小:136kb
提供者:
weixin_42113552