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搜索资源列表

  1. bioinf-commons:Kotlin中的生物信息学图书馆-源码

  2. 生物常见病 生物信息学图书馆。 内容 org.jetbrains.bio.dataframe像org.jetbrains.bio.dataframe大熊猫 org.jetbrains.bio.experiment命名计算-实验和资源配置 org.jetbrains.bio.genome用于基因组，序列，基因，本体等的API。 containers -基因组位置集API coverage -基因组覆盖率API，配对/单端，片段大小估计 data -描述任何种类的数据集资源，包括重复数据 for

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42133969

  1. Structurale:Cours生物信息结构II-源码

  2. 生物信息学专业 巴黎萨克莱大学 指数

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：619520
    • 提供者：weixin_42134143

  1. joe-benthos:胡德运河和圣胡安eDNA序列数据的生物信息学管道-源码

  2. 乔·本索斯 概括 最初尝试重现和扩展胡德运河和圣胡安群岛eDNA数据的分析。 上提供了原始数据和原始生物信息学管道。相关的海洋酸化项目和管道可。 初始方法和结果 工作流程 从Gannett检索数据 运行MultiQC 使用解复用样本 dada2的去噪和滤波序列 使用Insect 1.2分配分类单元 要重现此工作流程，请参见 目录结构 /analysis/用于分类单元分配数据整形，数据探索和可视化的代码。 /all.the.useful.tables/分类单元分配和数据整形的输出表。 /code

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-11
    • 文件大小：40894464
    • 提供者：weixin_42132056

  1. bioinformatics-general_commands:一线命令，用于生物信息学任务-源码

  2. 生物信息学中的命令行实用程序 自从论文实习开始以来，我发现并应用了几种不同的命令，以便完成生物信息学中的某些任务。 现在，我是一名博士研究生，但我​​仍在学习一些执行生物信息学任务的新奇方法。 这是我一直在使用的一些命令。 该页面不断更新。 我还在NGS分析中添加了一些常用的命令配置。 作业系统 所有这些命令都在Linux机器（主要是Ubuntu和CentOS）上执行。 重击 显示第2行的文本文件。 tail --lines=+2 按数字对列2进行排序。 sort -n -k2 打印最后

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：3072
    • 提供者：weixin_42097668

  1. iSanXoT:使用SanXoT工作流程定量高通量蛋白质组学的生物信息学框架-源码

  2. iSanXoT 定量高通量蛋白质组学，系统生物学以及统计分析，实验的集成和比较的工作流程。 此工作流程由CNIC心血管蛋白质组学实验室/蛋白质组学开发 安装 下载 从存储库克隆或下载发行版 执行安装脚本 Windows发行版 Execute the batch scr ipt "install_win64.bat" 注意：要求使用Microsoft Visual Studio，但必须使用C ++ languange ！！！ Windows Python需要通过SDK安装的Visual C ++

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：6291456
    • 提供者：weixin_42140716

  1. dna-analysis-coursera：Coursera生物信息学代码-源码

  2. dna分析课程 Coursera生物信息学代码

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-04
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42110533

  1. 第6单元-整合生物信息学：DiplômeUniversitaire en Bioinformatique Integrative（DU-Bii）的整合生物信息学课程-源码

  2. 模块6-生物信息集成 支持后续版本 版 地点 2021年 2020年 2019年 链接 文件 描述 网址 Git页面 课程的网站（查看支持） Git仓库 可以在计算机上下载或克隆教学资料的存储库

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-03
    • 文件大小：159383552
    • 提供者：weixin_42128015

  1. phylo-seq-cap：使用新型基因组测序平台的系统信息学和种群基因组学生物信息学流水线-源码

  2. 使用有针对性的序列捕获来识别杨树和柳树之间的进化关系 该存储库包含用于创建我设计的新型基因分型平台的脚本和分析笔记本，其实现在我即将发表的论文《针对柳柳科的系统发育和种群基因组学的靶向序列捕获阵列》中有所报道，。 内容 ：此文件 ：详细介绍Jupyter笔记本格式手稿中报告的分析的笔记本 ：用于靶标捕获的探针序列，以及HybPiper用于基因序列组装的靶标参考文件 ：我编写的Python脚本，用于设计序列捕获数组并分析结果数据 通过有针对性的序列捕获获得的原始阅读数据将在手稿被接受出版后

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-02
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_42098251

  1. 生物信息学问题-源码

  2. 生物信息学问题

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：20480
    • 提供者：weixin_42099814

  1. 生物信息学算法-源码

  2. 欢迎！ 该存储库包含我在Phillip Compeau和Pavel Pevzner撰写的《生物信息学算法：一种主动方法》中算法的许多实现。 已针对rosalind.info（与文本相对应的网站）上的数据集测试了该存储库中的每个文件。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：38912
    • 提供者：weixin_42126865

  1. Deep_diversification_AAV：与AAV的深度多元化相关的论文的生物信息学代码-源码

  2. 生物信息学管道概述 本文总结了生物信息学分析的两个主要组成部分，该信息用于生成和解析论文。 对于机器学习模型，。 数据文件夹中提供了已处理的数据版本（该外观应类似于处理管道输出的内容）。 对于其他注释和包含训练数据，请使用。 有关原始测序数据， 。 步骤1 ：组装相应蛋白质序列变体的核苷酸序列，以便可以生成并使用所需的克隆策略进行加工。 步骤2 ：测试步骤1产生的数据帧，以确保库具有预期的组成，同时还测试每个序列中是否存在正确的RE位点。 此步骤将生成文件，并发送给安捷伦进行综合。 步骤3

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-20
    • 文件大小：36700160
    • 提供者：weixin_42162978

  1. Coursera-生物信息学-II-源码

  2. Coursera-生物信息学-II

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-20
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42131443

  1. BioinfinvRepro：可重现的生物信息学简介-源码

  2. 介绍可再生的亲和力基因组生物学信息 墨西哥国立自治大学墨西哥分校医学与医学研究中心创世记。 说明书： 德拉Alicia Mastretta Yanes博士CatedráticaCONACYT-CONABIO， 德拉Camille Truong博士。 墨西哥国立自治研究所， 维罗尼卡·雷耶斯·加林多·埃斯图安特·科拉多 里卡多韦尔杜戈萨尔加多博士，博士PROFESOR Asistente，Programa德遗传学Humana公司，洲际弹道导弹，Facultad德MEDICINA，U.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：51380224
    • 提供者：weixin_42157188

  1. PCRPpipeline：用于处理PCRP数据集的生物信息学管道-源码

  2. PCRP管道 用于处理PCRP数据集的生物信息管道 管道要求 python 2.7.14 python-matplotlib Java 8或更高版本 perl v5.10.1或更高版本 bedtools v2.27.1或更高版本 samtools 1.7 MEME v5 + ChExMix v0.45在这里可用： : 编译的JAR应该移到此处：/ QC-pipeline / external_app / 运行管道的命令： sh 11_RUN_MEP_QC_XO.sh -s samp

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：22020096
    • 提供者：weixin_42134144

  1. 罗莎琳德：罗莎琳德生物信息学问题-源码

  2. '''Rosalind解决方案'''

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：120832
    • 提供者：weixin_42165018

  1. BioAlgo：从头开始的生物信息学算法-源码

  2. 从头开始的生物信息学算法 此存储库包含用于Python的代码，这些代码来自于生物信息学算法： Compeau和Pevzner的主动学习方法。 用于教育目的 有关更多信息，请参见项目Wiki。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：27648
    • 提供者：weixin_42144199

  1. ClusterFlow：一种流水线工具，用于自动化和标准化集群环境中的生物信息学分析-源码

  2. 用户友好的生物信息学工作流程工具 在找到包含信息和示例的Cluster Flow文档。 Cluster Flow是在高性能集群环境中自动化和标准化生物信息学分析的流水线工具。 它被设计为易于使用，快速设置和灵活配置。 群集流是用Perl编写的，通过将作业启动到群集来工作（也可以在本地运行）。 每个作业都是围绕感兴趣的生物信息学工具的独立Perl可执行包装。 模块收集大量的日志记录信息，并且“集群流”向用户发送电子邮件，其中包含管道命令的摘要以及完成后的退出代码。 安装 您可以在上找到要下

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42103128

  1. 山核桃：预测生态系统分析仪（PEcAn）是一个集成的生态生物信息学工具箱-源码

  2. 我们的愿景 最佳可用数据和模型为生态系统科学，政策和管理提供了信息 我们的任务 开发和推广可访问的工具，用于可复制的生态系统建模和预测 什么是PEcAn？ 预测性生态系统分析仪（PEcAn）（请参阅 ）是一个集成的生态生物信息学工具箱（Dietze等，2013； LeBauer等，2013），它包括：1）科学的工作流程系统，用于管理大量的公众可用环境数据和2）贝叶斯数据同化系统，以在最新的生态系统模型中综合此信息。 这个项目的动机是，有关全球变化的许多最紧迫的问题并不一定受到收集新数据的需求以

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：60817408
    • 提供者：weixin_42171132

  1. sc2-illumina-pipeline：CZ Biohub上用于SARS-CoV-2测序的生物信息学管道-源码

  2. SARS-CoV-2共识基因组管道 该管道从fastq文件生成共识SARS-CoV-2基因组。 我们将其用于以下类型的测序数据： 丰富的SARS-CoV-2读本的元基因组测序（ ）。 基于扩增子的短读测序（使用ARTIC v3协议）。 典型用法 为了从阅读中生成共有基因组： nextflow run czbiohub/sc2-illumina-pipeline -profile artic,docker \ --reads '[s3://]path/to/reads/*_R{1,

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-31
    • 文件大小：10485760
    • 提供者：weixin_42125192

  1. bioinformatics-one-liners：Ming Tang的生物信息学一线-源码

  2. bioinformatics-one-liners：Ming Tang的生物信息学一线

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-30
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42178688
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