注册会员 | 设为首页 | 加入收藏夹
您好，欢迎光临本网站！[请登录] ！[注册会员]！  

搜索资源列表

  1. 从Enju分析器结果中提取蛋白质依存关系路径用于PPI任务提取路径特征

  2. 蛋白质关系抽取（PPIE）任务有时需要提取句法特征，比如，蛋白质之间的依存路径特征。 该工具能够从Enju句法分析器的结果中提取出标记蛋白质之间的依存关系路径。具体使用方法在工具使用说明中可以看到。 该工具贡献给PPI方向的研究者使用，希望大家提出宝贵意见，谢谢。

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2014-06-01
    • 文件大小：664kb
    • 提供者：quinewang

  1. 小麦冠层反射光谱与籽粒蛋白质含量及相关品质指标的定量关系

  2. 小麦冠层反射光谱与籽粒蛋白质含量及相关品质指标的定量关系，李映雪，朱艳，研究了不同施氮水平下小麦籽粒蛋白质含量及相关品质性状与冠层反射光谱、植株氮素状况之间的定量关系。结果表明，小麦灌浆期冠层

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-03-02
    • 文件大小：291kb
    • 提供者：weixin_38701952

  1. 啤用大麦β-淀粉酶活性的品种和环境变异及其与蛋白质含量的关系

  2. 啤用大麦β-淀粉酶活性的品种和环境变异及其与蛋白质含量的关系，张国平，Chen Jinxin，以8个啤用大麦品种为材料种植在7个生态条件差异很大的地区，研究籽粒β-淀粉酶活性的品种和环境效应及其与蛋白质含量的关系。结果�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-03-01
    • 文件大小：283kb
    • 提供者：weixin_38548231

  1. 核酸、氨基酸序列和蛋白质二级结构之间关系的探究

  2. 核酸、氨基酸序列和蛋白质二级结构之间关系的探究，马鹏，王联结，核酸序列中是否存在蛋白质空间结构信息？根据通常情况下遗传密码表中密码子中间位的碱基配对时产生的氢键数目，尝试将20种氨基酸�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-18
    • 文件大小：332kb
    • 提供者：weixin_38514501

  1. 蛋白质二硫键异构酶在染砷家兔皮肤中的表达变化

  2. 蛋白质二硫键异构酶在染砷家兔皮肤中的表达变化，郎曼，吴军，目的 观察亚砷酸钠（ iAs3+）染毒对家兔皮肤蛋白质二硫键异构酶（protein disulfide isomerase，PDI）的影响，探讨PDI与砷致皮肤损害的关系。�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-04
    • 文件大小：490kb
    • 提供者：weixin_38657376

  1. 基于关系相似性的蛋白质交互作用识别

  2. 基于关系相似性的蛋白质交互作用识别

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：262kb
    • 提供者：weixin_38665162

  1. 基于新的类似于光谱的图形表示的蛋白质序列相似度/不相似度分析

  2. 序列比较是生物信息学的基础之一，可用于研究序列之间的进化关系。 在这项研究中，基于氨基酸的疏水性尺度，提出了蛋白质序列的二维光谱状图形表示。 采用4个子序列的振幅频率来表征类似频谱的图，并使用17D矢量作为蛋白质序列的描述符。 执行兼容性测试的chi（2）值。 在所有蛋白质序列上都展示了一种新的相似性分析方法，该序列由20种不同物种的线粒体基因组编码。 最后，与ClustalW方法的比较显示了我们方法的实用性。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：819kb
    • 提供者：weixin_38617001

  1. 基于最短依赖路径的卷积神经网络（sdpCNN）用于蛋白质-蛋白质关系提取

  2. 基于最短依赖路径的卷积神经网络（sdpCNN）用于蛋白质-蛋白质关系提取

  3. 所属分类：其它

  1. 细胞内蛋白质稳定性与溶剂可及氨基酸的特定特征之间的关系

  2. 蛋白质降解对于大多数细胞过程至关重要，包括细胞周期进程，信号转导和分化。 深入研究蛋白质序列和结构中的降解信号有助于基于高通量数据集分析蛋白质稳定性。 与其他蛋白质功能相似，暴露于溶剂表面的关键残基和蛋白质表面的局部特定结构（例如裂口和口袋）可能在蛋白质降解中起关键作用。 在本文中，我们基于蛋白质溶剂可及表面的序列和结构特征，深入研究了影响蛋白质降解的内在因素。 结果表明，与长寿蛋白相比，短寿蛋白表面存在更多的疏水残基。 二级结构如线圈倾向于在短寿命蛋白质的表面上。 寿命短的蛋白质表面上有更多的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：702kb
    • 提供者：weixin_38703277

  1. 生物医学文献中的一种蛋白质-蛋白质相互作用的三重杂交提取方法

  2. 蛋白质-蛋白质相互作用提取研究可广泛应用于生命科学研究领域。 但是，大多数基于机器学习的方法都专注于二进制PPI关系提取，这会丢失对PPI研究至关重要的丰富的关系类型信息。 基于规则的开放信息提取方法可以提取PPI三元组（即“蛋白质1，相互作用词，蛋白质2”），但存在召回率低的问题。 在本文中，我们提出了一种混合蛋白-蛋白相互作用的三重提取方法。 在这种方法中，首先，机器学习技术用于识别蛋白质实体并提取相关的蛋白质对。 然后，使用句法模式和字典来找出代表两个蛋白质之间关系的对应交互词。 该方法在

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：960kb
    • 提供者：weixin_38670065

  1. 使用图嵌入从多个蛋白质相互作用网络中检测蛋白质复合物

  2. 细胞过程通常由蛋白质复合物而不是单个蛋白质进行。 鉴定蛋白质复合物是理解细胞组织和功能原理的关键之一。 同样，蛋白质复合物是一组在相似疾病中潜在的相互作用基因，这指出了蛋白质复合物的治疗重要性。 随着生命科学和计算科学的发展，越来越多的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据变得可用，这使得从PPI网络预测蛋白质复合物成为可能。 但是，由高通量实验产生的大多数PPI数据通常具有许多错误的正相互作用和错误的负边缘损失，这使得难以准确预测复合物。 在本文中，我们提出了一种称为MEMO（用于coMplex

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：1017kb
    • 提供者：weixin_38543749

  1. PC-SENE：基于节点嵌入的蛋白质复合物检测方法

  2. 随着蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据集的积累，已开发出各种计算方法来从PPI网络识别蛋白质复合物。 但是，许多现有的计算方法都有其自身的局限性：有监督的学习方法需要乏味的工作来进行特征工程，用于指导无监督方法的挖掘过程的质量度量在反映PPI网络中蛋白质复合物的特性方面存在一些缺陷。 在这项工作中，我们提出了一种新颖的蛋白质复合物检测方法，称为PC-SENE。 对于给定的种子，它使用基于蛋白质节点嵌入相似性的别名采样策略来选择潜在的可加节点，并利用一种新的电导度量来决定是否扩展当前的候选子图以

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：144kb
    • 提供者：weixin_38500630

  1. 基于图聚类的蛋白质功能预测方法

  2. 利用蛋白质序列的循环关系，采用循环匹配算法对数据进行预处理，得到相关联蛋白质数据集，再利用该数据集构造蛋白质的网络图，在此基础上采用图聚类算法，对待预测的蛋白质相关的各个蛋白聚类，并进行子群分割，对各个子群采用 z 值进一步计算并得出作为预测结果的蛋白质功能． 经实验，该方法与其它最新方法相比较，预测结果的最终衡量指标 F1-measure 具有明显的提升

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：651kb
    • 提供者：weixin_38695773

  1. SRD：基于无向图的DNA /蛋白质序列关系可视化通用软件工具

  2. 为了加快翻译生物信息学的研究，本研究提出了一种通用软件工具，称为序列关系图程序（SRD）。 它可用于在基因和蛋白质序列相似性分析中基于无向图，动态显示分子序列及其类别之间的关系。 SRD由两个组件组成：基于窗口的应用程序和计算机数据库。 研究人员可以将他们的数据集导入数据库，这将使软件运行速度更快并占用更少的内存。 预先计算的序列关系和其他用户定义的信息也可以导入到系统中，然后在多个交互角度中可视化。 可以将序列划分为几个类别，并提供和链接多个窗口以分别涉及类别内，类别外和类别-类别关系的可视化

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：905kb
    • 提供者：weixin_38640117

  1. 使用域间相互作用网络对蛋白质结构域和复杂疾病之间的关联进行优先排序

  2. 找到人类复杂疾病的基础遗传变异并找到导致这些疾病的基因至关重要。 由于蛋白质通常由几个结构域组成，因此可以合理地假设有害的遗传变异可能会改变蛋白质域的结构，影响蛋白质的功能并最终导致疾病。 基于这种理解，作者探索了恢复蛋白质结构域与复杂疾病之间关联的可能性。 作者根据非同义单核苷酸多态性（nsSNPs）与复杂疾病之间的关联，疾病之间的相似性以及蛋白质与领域之间的关系来定义蛋白质域与疾病家族之间的关联。 基于域域交互网络，作者提出了一种“按罪恶感”原则，根据候选域与域域交互网络中与一组种子域的平均

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：401kb
    • 提供者：weixin_38624437

  1. 依存信息在蛋白质关系抽取中的作用

  2. 基于核函数的蛋白质关系(PPI)抽取可以捕获结构化信息,取得了较高的性能,但其计算复杂度过高。该文结合词汇、句法等信息,重点探讨了依存信息对基于特征向量的蛋白质关系(PPI)抽取的影响。在多个PPI语料库上的实验表明,依存信息和基本短语块信息可以有效提高基于特征向量的PPI抽取性能。特别要指出,在AIMed语料上的PPI抽取取得了54.7的F测度,是目前基于特征向量的PPI抽取系统的最好水平。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：879kb
    • 提供者：weixin_38570519

  1. 黑腹果蝇蛋白质编码区碱基分布与起始密码子及终止密码子的关系

  2. 黑腹果蝇蛋白质编码区碱基分布与起始密码子及终止密码子的关系

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：232kb
    • 提供者：weixin_38575118

  1. BioPPIExtractor：用于生物医学文献的蛋白质-蛋白质相互作用提取系统

  2. 从生物医学文献中自动提取蛋白质-蛋白质相互作用信息可以帮助建立蛋白质关系网络，预测蛋白质功能并设计新药。 本文介绍了用于生物医学文献的蛋白质-蛋白质相互作用提取系统BioPPIExtractor。 该系统将条件随机场模型应用于生物医学文本中的蛋白质名称，然后使用链接语法分析器来识别句子中的句法角色，最后通过分析句法角色的匹配内容及其在语言上的重要组合，提取出完整的相互作用。 使用其他两种最先进的提取系统进行的实验评估表明，BioPPlExtractor系统具有更好的性能。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：400kb
    • 提供者：weixin_38733245

  1. 从头预测蛋白质骨架的一种并行蚁群方法及其在CASP8/9中的应用

  2. 从低同源关系的氨基酸序列预测蛋白质的三维结构被称为从头预测,它是计算生物学领域中的挑战之一.蛋白质骨架预测是从头预测的必要先导步骤.本文应用一种基于共享信息素的并行蚁群优化算法,在现有能量函数指导下,通过不同能量项之间的定性互补,构建具有最低能量的蛋白质骨架结构,并通过聚类选择构象候选集合中具有最低自由能的构象.在CASP8/9所公布的从头建模目标上应用了该方法,CASP8的13个从头建模目标中,模型1中有2个目标的预测结果超过CASP8中最好的结果,7个位列前10名;CASP9的29个从头建模

  3. 所属分类：其它

  1. linnaeo：用于查看，分析和生成蛋白质序列比对的图-源码

  2. Linnaeo：一种蛋白质序列比较工具 Linnaeo是一个程序，旨在通过提供一种比较蛋白质序列的简便方法来帮助得出有关蛋白质的结构-功能关系的结论。 在您感兴趣的物种中，通常无法很好地理解一种生物体中被充分研究的蛋白质（也许是已知的结构，或者已经进行了很多酶学研究）。 进行比对可以帮助您找到与这些替代蛋白序列中表征的残基相当的残基，并根据保守程度的高低建议其他重要的残基。 因此，Linnaeo旨在允许您： 在文件夹中存储和组织要跟踪的蛋白质序列 使用MUSCLE算法从这些序列的不同组合动态

  3. 所属分类：其它

« 12 3 4 »