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搜索资源列表

  1. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列

  2. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列，直接编译，将英文氨基酸序列粘贴到窗口，按回车即可输出转换结果。

  3. 所属分类：教育

    • 发布日期：2018-05-18
    • 文件大小：2048
    • 提供者：dbswhr

  1. 蛋白质序列中的关联规则发现及其应用

  2. 蛋白质序列中的关联规则发现及其应用，陈双平，郑浩然，蛋白质序列分析中使用的机器学习算法越来越复杂，导致其结果的解释和发现过程也随之复杂化。因此，有必要寻找简单且理论上可靠的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-22
    • 文件大小：330752
    • 提供者：weixin_38608189

  1. PseAAC-Builder 2.0: 一种从蛋白质序列数据快速生成伪氨基酸组分表示的软件

  2. PseAAC-Builder 2.0: 一种从蛋白质序列数据快速生成伪氨基酸组分表示的软件，杜朴风，，本文描述了一种用于快速的将大规模蛋白质序列数据转换成伪氨基酸组分的软件。这一软件称为PseAAC-Builder 2.0. 这一软件比现有软件具有�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-02
    • 文件大小：280576
    • 提供者：weixin_38712279

  1. 蛋白质序列的新型二维图形表示及其应用

  2. 蛋白质序列的新型二维图形表示及其应用

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-24
    • 文件大小：187392
    • 提供者：weixin_38701640

  1. 一对一（Pse-in-one）：一种Web服务器，用于生成DNA，RNA和蛋白质序列的各种伪成分模式

  2. 一对一（Pse-in-one）：一种Web服务器，用于生成DNA，RNA和蛋白质序列的各种伪成分模式

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-20
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38606076

  1. 基于线性回归和理化性质的直观的蛋白质序列可视化图形方法

  2. 基于线性回归和理化性质的直观的蛋白质序列可视化图形方法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：158720
    • 提供者：weixin_38635975

  1. 利用蛋白质序列结构特征预测蛋白质结构类别的新策略

  2. 利用蛋白质序列结构特征预测蛋白质结构类别的新策略

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：100352
    • 提供者：weixin_38741531

  1. 基于格雷码的蛋白质序列的3D图形表示

  2. 基于格雷码的蛋白质序列的3D图形表示

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：589824
    • 提供者：weixin_38707217

  1. 基于假氨基酸组成的蛋白质序列相似性分析

  2. 我们使用20个氨基酸的出现频率，并基于三个物理化学性质指标作为假氨基酸成分，采用二维图形表示的新数值特征。 将蛋白质序列转换成23维向量后。 最后，基于欧几里德距离，使用九种物种的ND5蛋白的相似性来证明我们方法的有效性和合理性。 并且提供了相关性分析，以将我们的结果和基于其他图形表示的结果与Clustal W的结果进行比较，以显示我们的方法的实用性。 （C）2013 Elsevier BV保留所有权利。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38626179

  1. 基于新的类似于光谱的图形表示的蛋白质序列相似度/不相似度分析

  2. 序列比较是生物信息学的基础之一，可用于研究序列之间的进化关系。 在这项研究中，基于氨基酸的疏水性尺度，提出了蛋白质序列的二维光谱状图形表示。 采用4个子序列的振幅频率来表征类似频谱的图，并使用17D矢量作为蛋白质序列的描述符。 执行兼容性测试的chi（2）值。 在所有蛋白质序列上都展示了一种新的相似性分析方法，该序列由20种不同物种的线粒体基因组编码。 最后，与ClustalW方法的比较显示了我们方法的实用性。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：838656
    • 提供者：weixin_38617001

  1. ProteinEvolverABC:通过近似贝叶斯计算估计蛋白质序列比对中的重组和取代率-源码

  2. 蛋白质进化者 通过近似贝叶斯计算估计蛋白质序列比对中的重组和取代率 软件包ProteinEvolverABC是一个计算机框架，可通过近似贝叶斯计算来估计蛋白质序列多个比对中的重组和取代率。 该框架基于模拟器ProteinEvolver的特殊版本，该模拟器通过重组（包括各种迁移模型，人口统计学和用户指定的种群/物种树）和蛋白质在不同替代模型下的进化来实现合并。 可以从比对中收集有关进化过程的信息，总共可以计算出16个摘要统计量。 然后，ProteinEvolverABC可以通过拒绝和回归方法在近似

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-14
    • 文件大小：89128960
    • 提供者：weixin_42107491

  1. Protein-Lifetime-Project:此python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命，通过该规则，蛋白质半衰期由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算得出-源码

  2. 蛋白质终身计划 该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命，通过该规则，蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。 背景 90年代，亚历山大·瓦尔沙夫斯基（Alexander Varshavsky）和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是，N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物，从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此，据此，应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期，并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-12
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42166105

  1. 蛋白质序列的新型描述符及其应用

  2. 在本文中，基于氨基酸的三种物理化学特性，引入了蛋白质序列的动态3-D图形表示。 图的坐标具有直接的生物学意义，可以反映蛋白质的固有结构。 提取主惯性矩和轴坐标范围的信息作为一种新型的混合描述符，并提出用于蛋白质一级序列的比较。 同时，避免了所考虑的蛋白质序列的长度差异的影响的归一化描述符向量的欧几里德距离被用作蛋白质相似性的定量测量。 最后，我们以九种ND5（NADH脱氢酶亚基5）蛋白为例，说明了该方法的有效性。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：735232
    • 提供者：weixin_38706824

  1. 基于蛋白质序列信息预测蛋白质-蛋白质相互作用的新方法

  2. 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）对于几乎所有细胞过程都至关重要，包括代谢循环，DNA转录和复制以及信号级联。 不幸的是，用于识别PPI的实验方法既耗时又昂贵。 因此，开发用于预测PPI的计算方法很重要。 在本工作中，我们提出一种仅使用蛋白质序列信息进行PPI预测的方法。 该方法是基于学习算法-极限学习机（ELM）与本地蛋白质序列描述符的新颖表示法相结合而开发的。 局部描述符解释了蛋白质序列连续和不连续区域中残基之间的相互作用，因此该方法使我们能够从蛋白质序列中提取更多的PPI信息。 ELM是一种

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：843776
    • 提供者：weixin_38528680

  1. dRHP-PseRA：使用基于谱的伪蛋白质序列和秩聚合来检测远程同源蛋白质

  2. dRHP-PseRA：使用基于谱的伪蛋白质序列和秩聚合来检测远程同源蛋白质

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：995328
    • 提供者：weixin_38499349

  1. 基于现有K字的频率和位置熵的蛋白质序列特征量度

  2. 基于现有K字的频率和位置熵的蛋白质序列特征量度

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-03
    • 文件大小：227328
    • 提供者：weixin_38660579

  1. 通过蛋白质序列的多元互信息预测蛋白质-蛋白质相互作用

  2. 通过蛋白质序列的多元互信息预测蛋白质-蛋白质相互作用

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-01
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38529251

  1. SRD：基于无向图的DNA /蛋白质序列关系可视化通用软件工具

  2. 为了加快翻译生物信息学的研究，本研究提出了一种通用软件工具，称为序列关系图程序（SRD）。 它可用于在基因和蛋白质序列相似性分析中基于无向图，动态显示分子序列及其类别之间的关系。 SRD由两个组件组成：基于窗口的应用程序和计算机数据库。 研究人员可以将他们的数据集导入数据库，这将使软件运行速度更快并占用更少的内存。 预先计算的序列关系和其他用户定义的信息也可以导入到系统中，然后在多个交互角度中可视化。 可以将序列划分为几个类别，并提供和链接多个窗口以分别涉及类别内，类别外和类别-类别关系的可视化

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：926720
    • 提供者：weixin_38640117

  1. 在GPU上加速基于物种的蛋白质序列的Smith-Waterman对齐

  2. 在GPU上加速基于物种的蛋白质序列的Smith-Waterman对齐

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38621870

  1. 一种新颖的蛋白质序列与其串联质谱的匹配打分算法

  2. 一种新颖的蛋白质序列与其串联质谱的匹配打分算法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：737280
    • 提供者：weixin_38538021
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