基于人类全基因组Feb.2009(GRCh37/hg19版本)的基因注释数据，筛选得到12207个在TSS前后20kb内无重叠的基因．以人类GM12878和K562两种细胞系为研究对象，通过计算基因与转录因子CTCF的关联强度得分Aij以及TSS附近的DNA甲基化水平Mij，将12207个基因分为四个集合，分别统计了每个基因集合中TSS侧翼3800bp区域内的11种组蛋白修饰信号的分布情况．结果显示H2AFZ、H3K4me2、H3K4me3、H3K9ac、H3K27ac和H3K79me2这六种呈

转录因子的结合与组蛋白修饰对于基因表达的精确调控是至关重要的．基于染色质免疫共沉淀的二代测序技术得到了大量转录因子结合和组蛋白修饰的ChIP-seq数据，借助于信号峰搜索（Peak finders）算法，ENCODE数据库提供了转录因子结合和组蛋白修饰信号峰（Peaks）数据．利用人类GM12878与K562两类细胞系55种转录因子结合与11种组蛋白修饰最新的信号峰数据，统计了转录因子结合和组蛋白修饰在两类细胞系中全基因组范围及TSS附近的分布，计算了不同转录因子结合位点与组蛋白修饰的重叠率和平