在基于偏振编码的BB84协议的量子密钥分发(QKD)系统中，偏振控制系统是关键的一个环节。为了能够高效快速地恢复并稳定因光纤链路抖动以及环境温度变化等因素而受损的偏振态，分析了电动偏振控制器（EPC）的性能，引入了旋转矩阵作为偏振控制器的Müller矩阵，提出了规避盲区的策略，设计了非理想情况下的实时偏振控制算法。该算法在局部控制过程中只使用两个控制自由度即可完成期望输出的偏振态，极大地提高了控制速度。仿真结果验证了算法的可行性。