飞秒激光双光子（多光子）微纳加工技术，因其优异的可设计三维加工能力、高空间分辨率和低附加损伤，不仅得到了广泛而深入的研究，而且越来越多地具体应用在诸多前沿领域。介绍了飞秒激光直写技术在多种材料和多个领域的最新具体应用和进展，并着重介绍了生物材料的飞秒激光直写的相关工作。尤其是蛋白质类材料，以其独特的物理、化学、生物特性，结合飞秒激光直写的先进加工手段，使得多样化、功能化的生物相关微纳器件和系统得以实现。