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高通量测序DNA样品制备
Illumina 官方文库制备方法,讲述了如何将基因组DNA制备成适用于二代测序的library样品。
所属分类:
教育
发布日期:2012-03-15
文件大小:43kb
提供者:
gracehorse
高通量测序数据的组装及后续生物信息学分析
高通量测序数据的组装及后续生物信息学分析
所属分类:
教育
发布日期:2014-02-12
文件大小:4mb
提供者:
lbl0603
高通量测序生物信息学分析(内部极品资料_初学者必看
关于现在基于二代测序分析的一些生物信息方面的实验方法和专业名词的由来。
所属分类:
其它
发布日期:2014-11-21
文件大小:3mb
提供者:
holylowbo
新一代基因组测序:通往个性化医疗
关于高通量测序在个性化治疗及精准医疗中的作用
所属分类:
医疗
发布日期:2017-07-20
文件大小:47mb
提供者:
u011350251
Fastqc高通量测序质量控制
高通量测序下机第一步必备利器,检查reads质量,制定质控策略
所属分类:
医疗
发布日期:2018-05-01
文件大小:9mb
提供者:
dkbf123
高通量测序与大数据分析-农学篇
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:65mb
提供者:
licnyyu
《高通量测序与大数据分析-农学篇》多组学研究.
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:17mb
提供者:
licnyyu
《高通量测序与大数据分析-医学篇》微生物组研究
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:22mb
提供者:
licnyyu
高通量测序数据统计分析
包含RNA-seq数据分析、ChIP-seq数据分析、基因组拷贝数变异分析、稀有突变分析等
所属分类:
医疗
发布日期:2018-10-11
文件大小:8mb
提供者:
weixin_41960569
Python-bcbionextgen这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符合最佳实践的处理流程
bcbio-nextgen:这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符合最佳实践的处理流程
所属分类:
其它
发布日期:2019-08-11
文件大小:16mb
提供者:
weixin_39841365
蒙古口蘑子实体下土壤真菌多样性的高通量测序分析
蒙古口蘑子实体下土壤真菌多样性的高通量测序分析,杨岳,魏杰,为了调查蒙古口蘑子实体下土壤真菌多样性,了解蒙古口蘑子实体下土壤真菌的群落组分与结构,本研究通过采集蒙古口蘑子实体下土壤
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-10
文件大小:834kb
提供者:
weixin_38696143
高通量表达谱数据分析筛选灰葡萄孢侵染垫形成相关基因
高通量表达谱数据分析筛选灰葡萄孢侵染垫形成相关基因,张静,汤洁静,灰葡萄孢产生功能上类似于附着胞的侵染垫来侵染寄主植物。本文主要利用高通量测序对不形成侵染垫的灰葡萄孢弱毒菌株CanBC-1及其正�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-02
文件大小:961kb
提供者:
weixin_38680671
Python-bcbionextgen这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符合最佳实践的处理流程
bcbio-nextgen:这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符合最佳实践的处理流程
所属分类:
其它
发布日期:2019-08-10
文件大小:16mb
提供者:
weixin_39840387
NGSEPcore:NGSEP是用于分析高通量测序(HTS)读数的集成框架。 NGSEP的主要功能是变体检测器,它允许对具有拷贝数变异(CNV)的单核苷酸变体(SNV),插入,缺失和基因组区域进行综合发现和基因分型。-源码
NGSEPcore:NGSEP是用于分析高通量测序(HTS)读数的集成框架。 NGSEP的主要功能是变体检测器,它允许对具有拷贝数变异(CNV)的单核苷酸变体(SNV),插入,缺失和基因组区域进行综合发现和基因分型。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:35mb
提供者:
weixin_42129005
使用高通量测序读数识别微转化
使用高通量测序读数识别微转化
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:730kb
提供者:
weixin_38652870
htslib:高通量测序数据格式的C库-源码
HTSlib是用于访问常见文件格式(例如的统一C库的实现,该文件格式用于高通量测序数据,并且是和使用的核心库。 HTSlib仅取决于 。 已知与gcc,g ++和clang兼容。 HTSlib实现了通用BAM索引,其文件扩展名为.csi (坐标排序的索引)。 HTSlib文件阅读器首先查找新索引,然后在缺少新索引的情况下查找旧索引。 该项目还包括流行的tabix索引器和bgzip压缩实用程序,该索引器同时对.tbi和.csi格式进行索引。 构建HTSlib 有关完整的详细信息,请参见 。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42110038
基于新测序技术的比对与组装算法
针对新型超高通量测序仪Solexa测序仪所产生的测序片段read的比对与组装问题,提出一种短序列比对与组装算法SRMA,采用对参考序列进行hash的方法,将测序片段read分3段快速、准确地定位于参考序列,对不能定位的read采取从头(Denovo)组装的方法进行组装。测试结果表明SRMA算法具有较高的性能和敏感度,以及良好的应用前景。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:996kb
提供者:
weixin_38553431
fgbio:用于处理基因组和高通量测序数据的工具-源码
fgbio 一套用于分析基因组数据的工具,重点关注下一代测序。 本自述文档主要面向开发人员/贡献者以及试图从源代码构建项目的人员。 可在上找到详细的用户文档,包括和。 可以在找到详细的开发人员文档。 目标 有许多工具包可用于分析基因组数据。 fgbio的目标不是让所有人都拥有万物,而是专门致力于提供: 强大,经过测试的工具。 易于使用的命令行。 每种工具的清晰,完整的文档。 开源开发使社区和我们的客户受益。 总览 Fgbio是执行生物信息/基因组数据分析的一组命令行工具。 我们的客户和
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42122306
基于16S_rRNA高通量测序的西藏农牧区牦牛酸奶菌群多样性
基于16S_rRNA高通量测序的西藏农牧区牦牛酸奶菌群多样性
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-01
文件大小:722kb
提供者:
qq_34512987
高通量DNA测序数据的生物信息学方法
高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短,而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的挑战和机遇,总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具等研究成果。最后,展望了高通量测序下DNA短读序列数据研究的发展趋势。
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-20
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38669832
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