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高通量筛选的数据处理方法
高通量筛选对于数据处理有很高要求。文章重点描述了这个领域数据处理的方法
所属分类:
专业指导
发布日期:2008-10-24
文件大小:589kb
提供者:
wangjingyi1989
动物源食品兽药残留检测方法
目前,动物源食品中的兽药残留问题引起了世界各国的广泛关注,发展快速、简便、高灵敏度、高通量的兽药残留检测技术已成为迫切需要。介绍了理化分析法、免疫法、生物传感器法等检测技术在兽药残留检测中的应用现状与发展,并展望了兽药残留检测技术在今后的发展方向。提出今后兽药残留分析检测技术的发展方向为:更高的灵敏度和更低的检出限,更高的选择性、特异性和抗干扰能力,单位时间内分析更多样品,同时测定多种残留的兽药,前处理和测定的一体化;更多联用技术的发展;减少污染、实现环境友好。加强兽药残留筛选、定量、确证3个层
所属分类:
其它
发布日期:2020-05-08
文件大小:127kb
提供者:
weixin_38729022
蛋白酪氨酸磷酸酶SHP2抑制剂高通量筛选模型的建立和应用
蛋白酪氨酸磷酸酶SHP2抑制剂高通量筛选模型的建立和应用,邵伟,周越洋,目的 建立体外蛋白酪氨酸磷酸酶SHP2抑制剂的高通量筛选模型,筛选潜在的SHP2抑制剂。方法 应用大肠杆菌系统克隆表达GST-SHP2融合蛋白,
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-01
文件大小:239kb
提供者:
weixin_38718413
高通量实时荧光定量PCR方法筛选FL细胞对低剂量微囊藻毒素LR暴露的应答基因
高通量实时荧光定量PCR方法筛选FL细胞对低剂量微囊藻毒素LR暴露的应答基因,王秀敏,徐立红,应用高通量实时荧光定量PCR技术检测低浓度微囊藻毒素LR暴露后FL细胞基因mRNA表达的变化,筛选特异的应答基因。用0.2μmol/L的微囊藻毒素
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-28
文件大小:529kb
提供者:
weixin_38550459
曲古菌素A作用胃癌细胞系SGC-7901的基因芯片分析
曲古菌素A作用胃癌细胞系SGC-7901的基因芯片分析,李云龙,李晓林,目的: 探讨TSA促胃癌细胞系SGC-7901凋亡的作用机制。 方法: 采用基因芯片技术,通过高通量筛选胃癌细胞系SGC-7901经过TSA干预后基因表达�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-15
文件大小:933kb
提供者:
weixin_38609128
实验设计在高通量催化剂筛选中的应用
实验设计在高通量催化剂筛选中的应用,申弢,王聪,本文从统计学角度出发,探究了实验设计(Design of Experiment)在催化剂领域的应用。本文简述催化剂领域的主要课题类型,对变量筛选类�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-13
文件大小:204kb
提供者:
weixin_38623080
含细菌荧光素酶报告质粒的构建
含细菌荧光素酶报告质粒的构建,唐江涛,王成,luxAB基因编码的荧光素酶催化发光细菌生物发光反应。III型分泌系统(T3SS)是大多数植物病原细菌的关键致病系统。为高通量筛选特异性
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-10
文件大小:518kb
提供者:
weixin_38624914
胰腺癌多药耐药miRNA表达谱筛选及验证
胰腺癌多药耐药miRNA表达谱筛选及验证,刘雯静,徐建威,目的:通过高通量方法,筛选胰腺癌亲本株及其多药耐药株的miRNA表达谱,明确胰腺癌多药耐药相关的miRNAs。方法:应用Human Mirna V2 光纤�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-10
文件大小:529kb
提供者:
weixin_38514501
高通量表达谱数据分析筛选灰葡萄孢侵染垫形成相关基因
高通量表达谱数据分析筛选灰葡萄孢侵染垫形成相关基因,张静,汤洁静,灰葡萄孢产生功能上类似于附着胞的侵染垫来侵染寄主植物。本文主要利用高通量测序对不形成侵染垫的灰葡萄孢弱毒菌株CanBC-1及其正�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-02
文件大小:961kb
提供者:
weixin_38680671
关于结构生物学的文献
关于结构生物学的文献,高通量筛选相关,内容翔实
所属分类:
专业指导
发布日期:2013-02-22
文件大小:332kb
提供者:
bentona
高通量有毒化合物筛选的荧光成像监测光合自养高等植物悬浮培养的胁迫响应
已经从各种模型和农作物中建立了光合自养悬浮培养物,并证明其是有价值和强大的实验系统,用于评估初级和次级代谢对代谢和应激相关信号的协调反应。 悬浮培养的使用结合了在微孔板中处理微藻的便利性和测试高等植物生理反应的优势,特别是结合了通过PAM叶绿素荧光成像评估光合活性反应以及监测次生代谢产物变化的优势通过植物荧光团或引入的荧光探针的稳态荧光产生和生成ROS。 自养营养培养物具有多种优势,例如用于筛选和表征有毒化合物对高等植物的影响的快速,高度灵敏,坚固且高通量的实验系统。 这篇观点文章讨论并严格评估
所属分类:
其它
发布日期:2020-06-04
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38593723
zincsplit一种分割zinc数据的小工具
一种分割zinc数据的小工具,非常适合在虚拟筛选中应用autodock这类非并行高通量的筛选。
所属分类:
数据库
发布日期:2011-09-07
文件大小:213kb
提供者:
woaijiewoaijie
Screening-Li-adsorption-on-2D-metals-源码
筛选锂在2D金属上的吸附 该数据库基于标题为“ XXX”和链接的作品。 有6个文件: Li_adsorption.pth.tar:用于筛选Li吸附位点的最终GCN潜力。该潜在文件由CGCNN代码生成。 li_ads_2d.csv:训练集信息。第一列是DFT的功函数,第二列是DFT和GCN的Li吸附能,第三列是Jain等人建立的数据库的ID。 。 results_high_throughput.csv:物理简化模型的高通量结果,以及发现的吸附能与功函数之间的线性关系。第一列是Jain等人
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42116604
CRISPRi_Screening_AceticAcid:CRISPRi菌株文库的表型筛选[Smith等,2017,Mol Syst Biol(2017)13-源码
CRISPRi_筛选_醋酸 CRISPRi菌株文库的表型筛选乙酸耐受性 目的 我们筛选了一个CRISPR干扰文库,该文库由9000多种酿酒酵母菌株组成,其中所有必需和呼吸生长必需基因中的98%以上都被多个gRNA靶向。 创建该存储库的目的是为任何用户提供从原始数据开始重现整个分析的机会。 内容 该项目中描述的代码显示了如何(a)准备,(b)分析和(c)可视化此研究中生成的高通量表态学数据。 在该项目中,我们使用了两个高通量表象学平台 Scan-o-matic 先进行生物筛选微培养,然后进行P
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-15
文件大小:125mb
提供者:
weixin_42143092
Plastic-single-crystalline-van-der-Waals-structures:塑料vdW晶体-源码
塑料单晶范德瓦尔结构 在环境条件下,特别希望在块状无机半导体中本征可塑性和可变形性用于制造柔性电子器件。 大多数块状无机半导体本质上是脆性的。 最近,发现了几种本征塑料块状无机半导体,例如Ag2S,β-InSe,CrI3,CrCl3等。在此,进行了高通量计算和潜在塑料半导体的vdW层状晶体的筛选。 从开源2D晶体数据库2DMatPedia中,我们对双层晶体进行建模,然后计算相应的变形系数。 2d-2l.json文件包含所有计算的vdW晶体,包括单层和双层晶体的结构
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:2mb
提供者:
weixin_42116585
预测分子活性:使用QSAR机器学习模型预测有机分子与特定受体的分子结合活性-源码
预测分子活性 使用QSAR机器学习模型预测有机分子与特定受体的分子结合活性。 诸如此类的虚拟筛选技术通过减少经过高通量筛选的潜在药物的数量来降低药物发现的成本。 该项目表明,机器学习模型可以从药物的分子定量结构-活性关系(QSAR)数据有效预测候选药物。 该代码在ipynb文件中提供,该文件需要一段时间才能运行。 还提供了以科学论文格式对该项目的深入描述。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42144366
MatrixLM.jl:核心函数,用于获取矩阵线性模型的闭合形式最小二乘估计-源码
矩阵LM 核心功能为矩阵线性模型获得闭合形式的最小二乘估计。 方差收缩改编自Ledoit&Wolf(2003) 。 的延伸MatrixLM用于高通量遗传筛选应用是包。 有关更多详细信息,请参见相关论文及其可。 是一个相关的软件包,为矩阵线性模型的L 1惩罚化估计实现算法。 有关更多详细信息,请参见相关论文及其可。 安装 可以通过运行以下命令来安装MatrixLM软件包: using Pkg Pkg.add(PackageSpec(url="https://github.com/senr
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:19kb
提供者:
weixin_42138545
螳螂-ml-释放:螳螂-ml:随机半监督学习,可对高通量基因组筛选中的基因进行优先排序-源码
螳螂 介绍 mantis-ml是一个与疾病无关的基因优先排序框架,在scikit-learn和keras / tensorflow基础上实现了随机的半监督学习。 mantis-ml的名称来自希腊语“μάντης”,意为“算命先生”,“预测者”。 出版物-请引用: 。 迪米特里奥斯·维托西奥斯(Dimitrios Vitsios),彼得拉夫斯基(SlavéPetrovski)。 美国人类遗传学杂志(细胞出版社),2020年5月7日 基因优先图集: 该资源包含螳螂在6个专业的10个疾病领
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-04
文件大小:202mb
提供者:
weixin_42098104
基于双子代数的高通量筛选系统优化控制
为了提高控制效率,对一类新兴的离散事件系统,即高通量筛选系统,利用双子代数dioid同时从事件域和时间域进行建模.对于很多离散事件系统,期望的输入输出模型行为是进行优化控制时常用的指标.然而,根据实际控制要求,往往高通量筛选系统的优化指标还会考虑期望的状态轨迹或期望的输出轨迹.对此,研究dioid框架下具有不同优化指标的优化控制结构,并结合状态反馈和输出反馈进行讨论.最后通过实例说明了应用该控制结构的方法.仿真结果表明了所提出的优化控制方法的有效性.
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-13
文件大小:400kb
提供者:
weixin_38606202
rxdock:RxDock是rDock的分支。 笔记-git source code
RxDock:一种快速,通用且开源的程序,用于将配体对接至蛋白质和核酸 RxDock是一种快速且通用的开源对接程序,可用于将小分子与蛋白质和核酸对接。 它专为高通量虚拟筛选(HTVS)活动和绑定模式预测研究而设计。 RxDock主要用C ++编写,附件脚本和程序用C ++,Perl或Python语言编写。 完整的RxDock软件包需要少于50 MB的硬盘空间,并且可以在所有Linux计算机中编译(仅此刻)。 由于其设计和实现,它可以安装在计算群集上并可以部署在无限数量的CPU上,从而使H
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-25
文件大小:12mb
提供者:
weixin_42137022
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