自动对接已广泛用于结构/功能分析和分子设计中的生物分子复合物的预测。提供了数十种有效方法，在分子表示，能量评估和构象采样中采用了不同的权衡取舍，从而以合理的计算量提供了预测。 AUTODOCK结合了经验自由能力场与拉马克遗传算法，提供与关联的预测自由能结合构象的快速预测。 在我们手中，AutoDock3已被证明对我们研究的大约一半复合物有效。其余的一半在结合时显示受体的显着运动，因此需要在受体中进行更复杂的运动模型，通常在AutoDock3外部执行。这里描述的新版本的AutoDock-AutoD