1. 分子动力学模拟概论 1.1 分子动力学模拟的发展 1.2 分子动力学模拟的基本原理 1.3 分子动力学模拟相关软件 2. 分子动力学入门 2.1 基本设置 2.2 生成蛋白质结构文件（PSF） 2.3 蛋白质的溶质化 2.4 球状水体中泛素（Ubiquitin）的分子动力学模拟 2.5 立方水体中泛素（Ubiquitin）的分子动力学模拟 2.6 简单的结果分析 3. 分析方法 3.1 平衡态分子动力学模拟分析 3.1.1 每个残基的RMSD值 3.1.2 麦克斯韦-波尔兹曼（Maxwe

我们推导了多体B→D（∗）（→DY）τ（→Xν）ν衰减的螺旋振幅的紧凑表达式，特别是对于X =ℓν或π和Y =π或γ。 我们将来自所有十种可能的新物理四费米算子与任意耦合的贡献包括在内。 我们的结果捕获了可见τ和D ∗衰减产物在整个相空间中的干扰效应，而在将τ或D ∗或两者都视为稳定的分析中，这些结果被忽略。 对于标准模型，τ干扰效应是相当大的，形式上为mτ/ m B量级，并且在存在新物理学的情况下可能具有1量级的统一性。 在考虑τ或D *衰减产物的运动分布时，以及在实验中包括不可避免的相空间切