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DNAssist软件使用教程
DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA,RNA和蛋白质的基本数据,对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序报告(序列比对);②DNA的物化性质、限制性酶切位点图谱分析;③分析蛋白质的物化性质、抗原性、疏水性。
所属分类:
专业指导
发布日期:2012-03-07
文件大小:582kb
提供者:
vincent1988li
生物信息学,读后让人受益匪浅。
当前人类基因组研究已进入一个重要时期,2000 年将获得人类基因组的全部 序列,这是基因组研究的转折点和关键时刻,意味着人类基因组的研究将全 面进入信息提取和数据分析阶段, 即生物信息学发挥重要作用的阶段。 到 1999 年 12月 15日发布的第 115版为止,GenBank中的 DNA碱基数目已达 46亿 5 千万,DNA序列数目达到 535万;其中 EST序列超过 339万条; UniGene 的数目已达到 7万个;已有 25个模式生物的完整基因组被测序完成,另外的 70 个模式生物基因
所属分类:
专业指导
发布日期:2008-09-11
文件大小:594kb
提供者:
yaolei2008
DNA测序仪原理及应用
DNA测序仪原理及应用,DNA基因重组测序
所属分类:
其它
发布日期:2013-09-04
文件大小:2mb
提供者:
xiaowu8050
chromas 1
基因信息比对十分方便,例如DNA测序、蛋白测序等
所属分类:
桌面系统
发布日期:2014-12-20
文件大小:226kb
提供者:
yangjie2005393
数据算法 Hadoop Spark大数据处理技巧
《数据算法:Hadoop/Spark大数据处理技巧》介绍了很多基本设计模式、优化技术和数据挖掘及机器学习解决方案,以解决生物信息学、基因组学、统计和社交网络分析等领域的很多问题。这还概要介绍了MapReduce、Hadoop和Spark。, 主要内容包括:, ■ 完成超大量交易的购物篮分析。, ■ 数据挖掘算法(K-均值、KNN和朴素贝叶斯)。, ■ 使用超大基因组数据完成DNA和RNA测序。, ■ 朴素贝叶斯定理和马尔可夫链实现数据和市场预测。, ■ 推荐算法和成对文档相似性。, ■ 线性回
所属分类:
Hadoop
发布日期:2018-03-17
文件大小:172mb
提供者:
tianshan2010
数据算法 Hadoop Spark大数据处理技巧
《数据算法:Hadoop/Spark大数据处理技巧》介绍了很多基本设计模式、优化技术和数据挖掘及机器学习解决方案,以解决生物信息学、基因组学、统计和社交网络分析等领域的很多问题。这还概要介绍了MapReduce、Hadoop和Spark。 主要内容包括: ■ 完成超大量交易的购物篮分析。 ■ 数据挖掘算法(K-均值、KNN和朴素贝叶斯)。 ■ 使用超大基因组数据完成DNA和RNA测序。 ■ 朴素贝叶斯定理和马尔可夫链实现数据和市场预测。 ■ 推荐算法和成对文档相似性。 ■ 线性回归、Cox回归
所属分类:
spark
发布日期:2018-06-01
文件大小:100mb
提供者:
luofazha2012
网格操作系统
摘要:GOS(Grid Operating System)网格操作系统引入CPU的流水线加速技术、时间片令牌任务调度机制、DOL分工合作机制、辅链技术,完全保留区块链去中心化、去中介、去信任、数据透明而又不可篡改的特性,同时极大地提高了处理速度、降低了能耗,非常容易实现每秒亿次甚至数十亿次的交易处理,具有无限容量的数据存储能力,底层的网格链技术有机地将低功耗传感器、雾计算(边缘计算)和云计算链接起来,实现链、雾、云的融合一体,在此基础上可构建大数据应用、人工智能等各种分布式应用。GOS操作系统
所属分类:
Dapp
发布日期:2018-06-15
文件大小:427kb
提供者:
weixin_40175076
数据算法 Hadoop Spark大数据处理技巧
《数据算法:Hadoop/Spark大数据处理技巧》介绍了很多基本设计模式、优化技术和数据挖掘及机器学习解决方案,以解决生物信息学、基因组学、统计和社交网络分析等领域的很多问题。这还概要介绍了MapReduce、Hadoop和Spark。 主要内容包括: ■ 完成超大量交易的购物篮分析。 ■ 数据挖掘算法(K-均值、KNN和朴素贝叶斯)。 ■ 使用超大基因组数据完成DNA和RNA测序。 ■ 朴素贝叶斯定理和马尔可夫链实现数据和市场预测。 ■ 推荐算法和成对文档相似性。
所属分类:
Java
发布日期:2018-01-13
文件大小:76mb
提供者:
arterhwq
高通量测序与大数据分析-农学篇
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:65mb
提供者:
licnyyu
《高通量测序与大数据分析-农学篇》多组学研究.
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:17mb
提供者:
licnyyu
《高通量测序与大数据分析-医学篇》微生物组研究
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcr iptome resequencing),从而开
所属分类:
讲义
发布日期:2018-01-25
文件大小:22mb
提供者:
licnyyu
数据算法 Hadoop Spark大数据处理技巧
数据算法 Hadoop Spark大数据处理技巧的主要内容包括: ■ 完成超大量交易的购物篮分析。 ■ 数据挖掘算法(K-均值、KNN和朴素贝叶斯)。 ■ 使用超大基因组数据完成DNA和RNA测序。 ■ 朴素贝叶斯定理和马尔可夫链实现数据和市场预测。 ■ 推荐算法和成对文档相似性。 ■ 线性回归、Cox回归和皮尔逊(Pearson)相关分析。 ■ 等位基因频率和DNA挖掘。 ■ 社交网络分析(推荐系统、三角形计数和情感分析)
所属分类:
spark
发布日期:2018-10-31
文件大小:73mb
提供者:
together_cz
DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows
DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows,DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA,RNA和蛋白质的基本数据,对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序报告(序列比对);②DNA的物化性质、限制性酶切位点图谱分析;③分析蛋白质的物化性质、抗原性、疏水性。
所属分类:
医疗
发布日期:2019-05-26
文件大小:9mb
提供者:
wjjc1017
数据库名词解释之层次型 基因型 关系型
层次型数据库管理系统是紧随网状数据库而出现的。现实世界中很多事物是按层次组织起 来的。层次数据模型的提出,首先是为了模拟这种按层次组织起来的事物。层次数据库也是按记录来存取数据的。GSDB是基因组序列数据库,由美国新墨西哥州Santa Fe的国家基因组资源中心创建。GSDB收集、管理并且发布完整的DNA序列及其相关信息,以满足基因组测序中心需要。该数据库采用服务器-客户机关系数 据库模式,大规模测序机构可以通过计算机网络向服务器提交数据,并在发送之前对数据进行检查,以确保数据的质量。
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-03
文件大小:26kb
提供者:
weixin_38732463
松杨栅锈菌地理菌群的SCAR标记转换
松杨栅锈菌地理菌群的SCAR标记转换,曹支敏,张振,根据RAPD分析结果,对松杨栅锈菌西部和北方两大地理菌群RAPD扩增特异DNA片段进行SCAR标记转换。经pGEM-T载体克隆和测序、Sequman整合后,�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-18
文件大小:447kb
提供者:
weixin_38669881
MEF2A的启动子多态性致使启动子转录活性改变
MEF2A的启动子多态性致使启动子转录活性改变,刘本荣,熊龙根,目的:研究肌细胞增强因子2A(MEF2A)启动子多态对转录活性的影响。方法:采用长片段PCR扩增、Sanger法DNA测序等技术鉴定MEF2A启动子区的
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-02
文件大小:537kb
提供者:
weixin_38674050
原发性嗜酸粒细胞增多症发病机制的初步探讨
原发性嗜酸粒细胞增多症发病机制的初步探讨,傅建非,李冰,目的:初步探讨原发性嗜酸粒细胞增多症发病机制;方法:利用DNA直接测序法检测FGFR1基因、FLT3基因、MPL基因、JAK2、PTP1B基因突变在原发
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-05
文件大小:647kb
提供者:
weixin_38742927
Chromas(DNA测序分析软件) v2.6.5官方版 win+mac平台
Chromas是一款专业好用的DNA测序分析软件,使用这款软件可以方便用户对DNA的峰形图进行查看和编辑操作,软件支持ab1、scf以及ztr格式的图谱文件,并支持自动删除低质量序列(当质量数据可用时)或矢量序列,除此之外,软件还可以按照FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank或GCG格式、文本格式来导出,有需要的用户欢迎下载。
所属分类:
医疗
发布日期:2020-08-19
文件大小:57mb
提供者:
Hadoop27
RNA-seq、FPKM和Cuffdiff
RNA-seq RNA-seq即转录组测序技术,是将细胞内mRNA,nonconding-RNA等RNA或其中一些提取出来利用高通量测序技术进行测序和分析的技术,RNA-seq分析的主要目的是分析RNA对应基因的表达量。 RNA-seq的主要步骤如下:分离RNA——将RNA打断成小片段——RNA反转录为DNA,此后测序手段同DNA测序。 更详细步骤可参考: https://www.jianshu.com/p/d09e624efcab 前文提到RNA-seq的主要目的是得到RNA对应基因的表达丰度
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-06
文件大小:439kb
提供者:
weixin_38741966
高通量DNA测序数据的生物信息学方法
高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短,而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的挑战和机遇,总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具等研究成果。最后,展望了高通量测序下DNA短读序列数据研究的发展趋势。
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-20
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38669832
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