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Globin-like蛋白质折叠类型识别
蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容. 以SCOP中的Globin-like折叠为研究对象,选择其中序列同一性小于25%的17个代表性蛋白质为训练集,采用机器和人工结合的办法进行结构比对,产生序列排比,经过训练得到了适合Globin-like折叠的概形隐马尔科夫模型(profileHMM)用于该折叠类型的识别. 以Astral1.65中的68057个结构域样本进行检验,识别敏感度为99.64%,特异性100%. 在折叠类型水平上,与Pfam和SUPERFAMILY单纯使用序列比对构建的
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-05-11
文件大小:4194304
提供者:
growking