单细胞 在此存储库中，您会找到脚本，这些脚本可帮助您使用各种R包（例如“ Seurat”，“ SCDE”，“ scPred”，“ harmony”等）过滤，分析和可视化单个单元格数据。 这些脚本是为与基于单细胞UMI的转录组数据一起使用而编写的，并且已在来自适应的smartseq2协议和10x基因组学v3协议的约1000-150.000肠粘膜（T-）细胞的数据集中进行了测试。 看 用于示例数据和教程 了解可视化技巧

单细胞 单单元管道通过python callingMutation_Hg38_SC.py $wd/bamFile调用python callingMutation_Hg38_SC.py $wd/bamFile

cshl-singlecell-2017 2017年冷泉港实验室的单细胞分析课程 这是许多单节课程/教程之一。 在可以找到所有单个单元软件包，课程，教程，会议发言人的出色清单。 数据来源 在本课程中，我们将使用预先清理的数据进行演示。 如果您对数据的清理方式感兴趣（删除空间，在单元格条形码中添加"r1_" ，合并多个文件等）。 这是供您浏览的GitHub存储库： 依存关系 我们将在科学python生态系统之外使用一些其他依赖项。 Python最佳叶子排序（ polo ），Macosko201