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SpongeModule:预测miRNA海绵模块的计算机方法-源码
海绵模块 介绍 预测竞争性内源性RNA(ceRNA)或microRNA(miRNA)海绵模块是揭示模块一级ceRNA调控机制的挑战和有意义的任务。在此背景下的模块代表相互竞争的miRNA海绵组,它们容易成为实现生物学过程的功能单元。现有的用于识别miRNA海绵模块的计算机方法可分为三种类型:(i)基于网络的聚类,(ii)矩阵分解和(iii)逐步评估。 五个代表性模块发现方法进行比较 -基于网络的群集:SC + MCL,SPONGE + MCL -矩阵分解:CeModule,LAceModule
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-19
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42107561