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edge:有效地跟踪基因组的变化-源码
边缘 Edge使基因组与衍生自其的子基因组之间保持结构变化。用户通过将基于序列的操作(例如同源重组)应用于亲本基因组来创建修饰的基因组。用户可以注释或校正基因组上的序列; Edge会自动将更改应用于派生的基因组上的适当区域。 Edge有效地做到了这一点:在亲本基因组上进行更改需要O(1),并自动传播到修饰的基因组。 Edge为每个修饰的基因组使用O(D)的存储量,其中D是修饰的基因组与其亲本之间的差异数。当前的实现另外还保留了一个对基对编号的注释的高速缓存,但是该高速缓存是软数据,并且被无效
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:32mb
提供者:
weixin_42137022