分享一个好用的免费矩阵分析软件MatrixUser-MatrixUser2.0.rar 本帖最后由 JimmyJ 于 2013-10-13 11:52 编辑 分享一个好用的开源矩阵分析软件MatrixUser. 我的一个海外的同学建议我用的。感觉用起来非常像imagej或者Fiji，不过是基于Matlab的图形界面，所以可以直接支持Matlab下面的任何多维矩阵，无需数据转换。由于项目需要，经常需要显示一些4维数据，这个软件就帮了大忙了。据手册介绍，可以支持任意的维度。同时也集成了很多有用的图

fiji-win64直接解压无需安装是一款非常强大的图像处工具。是Fiji，这是一款强大的图像后处理软件，还有以下几个优点： （1）界面友好，支持多种的图像输入格式，最重要的就是可以读取Raw文件 （2）功能强大，里面有很多的图像处理函数。 可以统计直方图，可以进行拉伸，对于高于8bit的图像非常友好。 可以进行基于直方图的统计等等。 （3）开源，这点太棒了。一个免费的软件，配备有windows，linux以及mac等不同系统的软件，不受电脑系统的限制且软件内存非常小（不到100M）

斐济半自动毛细胞计数脚本 在2D图像中使用在斐济进行毛细胞计数的两个脚本。 补充资料 可以在Zenodo上找到StarDist2D模型和训练数据集 重要免责声明 迈尔斯实验室创建了StarDist。 提供了StarDist原始代码和文档。 我们使用这些资源创建了一个客户StarDist模型。如果使用这些脚本，还请引用以下原始文件： 用法 下载启用以下更新站点： 星际飞船 CSBD深 生物医药集团 使用我们的StarDist模型时，将Fiji中的TensorFlow设置设置为版本1.14.0。这是

SNT手稿脚本 该存储库托管用于汇编图形的脚本。 这些脚本旨在从订阅了Neuroanatomy更新站点的Fiji安装中运行，如。 依赖sciview / Cx3D功能的脚本还需要对SciView-Unstable更新站点的可选订阅。 由于数据是经常从外部服务器下载的，因此需要Internet连接。 下载 为了简化执行，我们提供了ZIP文件，这些文件预先捆绑了现有的斐济安装以及所有必需的更新站点订阅。 相同的ZIP文件还包含此存储库的内容。 这些自包含的ZIP文件在提供。 相反，如果您希望在

使用ACQUIFER工具进行斐济脚本编写 示例宏（.ijm）和jython脚本（.py）演示了斐济Acquifer更新站点提供的有用功能，或更常见的是acquifer java程序包提供的有用功能。 acquifer更新站点随附了其中的一些示例，这些菜单可在Acquifer> Examples菜单中找到。 通过将脚本文件拖放到斐济窗口中，可以在斐济中打开和运行示例。 当前，对于ImageJ宏语言，这些示例涵盖了从图像文件名提取元数据（请参阅示例> MetadataParsing ）