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phylo-源码
phylo
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:16kb
提供者:
weixin_42123191
ml-phylo-trees-源码
毫升树 数据 来自ransanec项目:基线,n6,n10和n15,具体取决于叶片数。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:98kb
提供者:
weixin_42135753
phylo-seq-cap:使用新型基因组测序平台的系统信息学和种群基因组学生物信息学流水线-源码
使用有针对性的序列捕获来识别杨树和柳树之间的进化关系 该存储库包含用于创建我设计的新型基因分型平台的脚本和分析笔记本,其实现在我即将发表的论文《针对柳柳科的系统发育和种群基因组学的靶向序列捕获阵列》中有所报道,。 内容 :此文件 :详细介绍Jupyter笔记本格式手稿中报告的分析的笔记本 :用于靶标捕获的探针序列,以及HybPiper用于基因序列组装的靶标参考文件 :我编写的Python脚本,用于设计序列捕获数组并分析结果数据 通过有针对性的序列捕获获得的原始阅读数据将在手稿被接受出版后
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-02
文件大小:2mb
提供者:
weixin_42098251
ung龙-源码
16种Palaung方言的自动系统发育和数据见Deepadung等。 CLDFBench使用etc / orthography.tsv和etc / lexemes.csv从raw / 100item-phylo.Sheet1.csv构造cldf / forms.csv。 接下来,cognate-detection.py根据以下方法的选择创建并显示16种Palaung方言的系统树:“ lexstatcogids”(部分),“ lexstatcogids”(完整),“ scacogids”(部分
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:96kb
提供者:
weixin_42119866
phylo-源码
phylo Rust中的系统进化学工具 注意: 该代码具有相当多的功能用途,但是在某些区域仍在进行清理。 我需要与rust-bio不同的对齐方式处理来处理某些PAML数据,这就是为什么当前将其单独实现的原因,尽管我很快会再次介绍。 在继续之前,我需要设置大量的测试并完成缺少的代码块。 还没有完全设置Travis集成或外部API。 未来: # # 入门 该项目需要安装Rust。 在带有Homebrew的OS X上,您只需运行brew install rust 。 然后运行它应该很简单:
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-12
文件大小:53kb
提供者:
weixin_42099755
生物门:Bio :: Phylo-使用Perl进行植物信息学分析-源码
Bio :: Phylo 面向对象的工具包,用于分析和处理系统信息。 描述 系统发育学是进化生物学的一个分支,致力于重建和分析生命树。 此分布提供了有助于处理和分析系统发育数据的对象和方法。 兼容性 Bio :: Phylo在Perl版本> = 5.8.0上的最流行的当前平台(Win32,OSX,Linux,Solaris,IRIX,FreeBSD,OpenBSD,NetBSD)上安装不会出现问题。 有关最新版本号的自动测试结果列表,请访问: 当前,Travis的主要修订版本的构建状
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42131785
Phylo.jl:Julia中的简单系统树可与Diversity.jl一起使用-https:github.comrichardreeveDiversity.jl-源码
Phylo.jl:Julia中的简单系统树可与Diversity.jl一起使用-https:github.comrichardreeveDiversity.jl
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-03
文件大小:847kb
提供者:
weixin_42165490
FishPhyloMaker:为一组当地鱼类建立系统发育史-源码
FishPhyloMaker 为当地鱼类种群建立系统发育 FishPhyloMaker软件包的核心功能是FishPhyloMaker ,该功能通过下载提供的系统发育并通过依次替换和丢弃原始系统发育的鱼类来编辑该系统发育来获得。系统发育树,仅包含数据框中指定的所需物种。 该过程从添加树中已经存在任何属的所有鱼类(同属物种)开始。 对于没有相同属的任何代表的物种,该功能将查找同一科的所有物种,如果树中不存在任何物种,则对相同顺序的物种进行搜索。 通过交互过程,用户必须指定树中要插入物种最相关的
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-31
文件大小:776kb
提供者:
weixin_42113380