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常用生物数据分析软件
第 1 章 Unix/Linux操作系统介绍...........................................................................................................1 1.1 远程登陆..............................................................................................................
所属分类:
嵌入式
发布日期:2010-08-04
文件大小:6mb
提供者:
shambalas
16s rRNA基因的获取(16s rDNA)
在NCBI上获取单个或整个属下多个物种的16s rDNA的方法
所属分类:
其它
发布日期:2010-11-13
文件大小:815kb
提供者:
xiaoyugutou1986
16S+rRNA序列分析法在大气微生物检测中的应用(1)
16S+rRNA序列分析法在大气微生物检测中的应用
所属分类:
其它
发布日期:2011-05-27
文件大小:150kb
提供者:
yeyeonly
基因组rRNA预测
基因组核糖体RNA预测,应用于真菌、细菌及线粒体,并统计rRNA类型,拷贝数,序列长度在基因组当中的占比,同时能够输出rRNA序列。
所属分类:
医疗
发布日期:2017-11-19
文件大小:7kb
提供者:
genome_denovo
1991 Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics
这本书非常经典的,是做微生物引用率非常高的,其中一章16S/23S rRNA sequencing,已被引用达数千次,我终于在国外大学图书馆找到,扫描成PDF版,希望对坐科研的人有所帮助。一定是你梦寐以求的。
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-04-07
文件大小:10mb
提供者:
enxilong
RNA的m6A和m1A修饰--表观转录组学初露峥嵘
RNA的m6A和m1A修饰--表观转录组学初露峥嵘,宋春雷,徐洲,表观转录组学是研究RNA(mRNA、tRNA、rRNA)转录后修饰的学科,是表观遗传学的重要分支。mRNA转录后的修饰主要是剪接和碱基修饰。目前�
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-14
文件大小:669kb
提供者:
weixin_38592502
家兔隐孢子虫分离株的种类鉴定及家兔回归试验
家兔隐孢子虫分离株的种类鉴定及家兔回归试验,齐萌,刘振伟,为收集兔隐孢子虫卵囊,采用饱和蔗糖溶液漂浮法对郑州市郊区某兔场的兔新鲜粪便样本进行检查,基于18S rRNA基因位点对隐孢子虫阳性�
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-10
文件大小:756kb
提供者:
weixin_38685455
柑桔木虱体内细菌多样性的DGGE和RFLP分析
柑桔木虱体内细菌多样性的DGGE和RFLP分析,田圣超,殷幼平,对野外采集的柑桔黄龙病的传播媒介昆虫柑桔木虱体内的微生物群落的多样性进行了研究。利用基于 16S rRNA基因作为分子标记的变性梯度
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-02
文件大小:420kb
提供者:
weixin_38689191
绵羊嗜皮菌病PCR诊断方法的建立
绵羊嗜皮菌病PCR诊断方法的建立,韩文星,陈玉,为建立一个PCR检测动物嗜皮菌病的方法。根据Genbank上发表的刚果嗜皮菌属的部分16s-rRNA基因序列,设计了一对特异性引物。经PCR扩增,从
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-27
文件大小:281kb
提供者:
weixin_38514526
显齿蛇葡萄实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证
显齿蛇葡萄实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证,张玉文,伊恒杰,采用RT-PCR方法,从显齿蛇葡萄中克隆得到Actin、18s-rRNA、GAPDH、α-tubulin、β-tubulin和UBQ 6个候选内参基因的编码区或部分序列。应用实时荧�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-12
文件大小:694kb
提供者:
weixin_38501610
洋葱核仁的超微结构动态变化特征和rRNA转录
洋葱核仁的超微结构动态变化特征和rRNA转录,尚广彬,施寒清,以洋葱为材料对细胞周期中核仁的结构的动态变化进行了追踪,发现在常规电镜下S期的核仁的表面与G1、G2相比出现了大量毛状突起并通�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-05
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38673812
海带配子体18S rRNA基因的克隆、序列分析及其作为内参基因的应用
海带配子体18S rRNA基因的克隆、序列分析及其作为内参基因的应用,周志刚,毕燕会,通过基因克隆和序列测定,获得了海带(Laminaria japonica)配子体的18S rRNA基因序列,其长度为1716 bp, GenBank登录号为EU293553。以蓝藻为外�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-01
文件大小:422kb
提供者:
weixin_38693753
16S rRNA克隆文库法分析成人龋病唾液微生物多样性
16S rRNA克隆文库法分析成人龋病唾液微生物多样性,李俊平,雷燕,目的:本研究目的在于讨论汉族人群中高龋和无龋人群口腔唾液微生物结构的差异。方法:采集符合WHO采样标准的唾液样本6例,其中高�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-30
文件大小:456kb
提供者:
weixin_38687539
16S rRNA基因序列分析法鉴定病原细菌
16S rRNA基因序列分析法鉴定病原细菌,朱飞舟,陈利玉,目的 运用16S rRNA基因序列分析法鉴定14种临床上常见的病原细菌,为该方法的临床应用奠定基础。方法 提取病原细菌的DNA,采用通用引物
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-06
文件大小:357kb
提供者:
weixin_38692928
高通量16S rRNA标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性
高通量16S rRNA标签测序法比较人与不同动物肠道微生物组多样性,邓冠华,查龙应,目的:比较人、大猪、小猪、大鼠、小鼠以及鸡的肠道细菌群落结构及多样性。方法:对上述物种,每种物种收集五个不同个体的粪便样
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-05
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38608189
16S rRNA序列分析技术在微生物宏基因组中的应用
16S rRNA序列分析技术在微生物宏基因组中的应用,刘文俊,张春林,本文对近几年来广泛应用于微生物分类、鉴定等研究领域的宏基因组技术进行了综述,尤其对基于16S rRNA基因序列分析等分子标记技术如�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-03
文件大小:362kb
提供者:
weixin_38685832
16s捕获:Pipleine代码,“通过广泛的16S rRNA富集来敏感鉴定临床标本中的细菌DNA”-源码
16S rRNA捕获管线 Pipleine代码,“通过广泛的16S rRNA富集来敏感鉴定临床标本中的细菌DNA” Sara Rassoulian Barrett [1],Noah G. Hoffman [1],Christopher Rosenthal [1],Andrew Bryan [1],Desiree A. Marshall [2],Joshua Lieberman [1],Brad T. Cookson [1],Stephen J. Salipante [1](通讯作者) [1]
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:1mb
提供者:
weixin_42108054
rRNA_counter:计算和比较基因组中的16S rRNA基因-源码
rRNA_计数器 计数和比较属或种内的16S rRNA基因 接受输入属并返回大量分析文件,主要是全长16S rRNA基因的系统树及其常见的扩增子。 这对于使用通用的元分类学方法确定某个属内的物种解析是否可能是有用的 安装 #从github克隆 git clone #创建conda环境表单yml文件 conda env创建-f rRNA_counter / rRNA_counter.yml #激活conda环境 conda激活rRNA_counter #设置文件的可执行权限 chmod
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-11
文件大小:27kb
提供者:
weixin_42143092
DMclust, a Density-based modularity method for picking OTU from massive 16S rRNA sequence data
DMclust, a Density-based modularity method for picking OTU from massive 16S rRNA sequence data
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-11
文件大小:1mb
提供者:
weixin_38532629
automate_16s:该项目的目标是使16s rRNA分析自动化,使其更易于访问-源码
自动化16秒 该项目的目标是致力于使16s rRNA分析过程自动化,从而可能使该过程更易于访问。 先决条件 基于Linux的系统 qiime 2 python3 安装 $ git clone https://github.com/lorentzben/automate_16s.git 克隆后,将创建一个名为automate_16s的文件夹。 里面将是: 自述文件 setup.py automate_16.py automate_single.sh automate_slurm_sub
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:37kb
提供者:
weixin_42097967
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