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搜索资源 - reCOGnizer:使用COG数据库进行基于域注释的工具-源码
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reCOGnizer:使用COG数据库进行基于域注释的工具-源码
识别器 使用数据库进行基于域注释的工具。 特征 reCOGnizer是使用RPS-BLAST和CDD数据库作为参考的蛋白质功能识别的用户友好实现。 它构建了数据库的分离版本,使RPS-BLAST可以在多线程中运行该数据库,从而大大提高了蛋白质注释中最耗时的步骤的速度。 将域分配给蛋白质后,reCOGnizer将CDD ID转换为相应DB的ID,并进一步获得CDD上可用的域描述 根据所涉及的数据库检索更多信息: 然后将这些COG整理到蛋白质与COG的关系表中,其中包括来自COG的三个功能分类。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-19
文件大小:201kb
提供者:
weixin_42128988