文件名称:
bcl2fastq:NextSeq特定的bcl2fastq2包装器-源码
开发工具:
文件大小: 11kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明：NextSeq .bcl转换
bcl_to_fastq运行带有可选效果的bcl2fastq到“样本表”，并将跨通道的读取按样本连接到R1和R2中。 默认情况下，成功时将删除各个通道的不确定和读取，并将所有读取放置在BaseCalls目录中。
在bcl2fastq2转换软件v2.17.1.14以及Python 2.7和3.5上进行了测试。
跑步
$ cd /data/nextseq/170111_NS500409_0130_AHHGTMAFXX/SampleSheet.csv
$ bcl_to_fastq --reverse-complement --processing 80
[2017-01-14 19:07:57 - INFO] Using /data/nextseq/170111_NS500409_0130_AHHGTMAFXX/SampleSheet.csv
[2017-01-1
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