文件名称:
cnF2freq:计算单谱和基因型概率，并在任意谱系中进行归因，包括可能存在观察错误的情况-源码
开发工具:
文件大小: 62kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-16
详细说明：cnF2freq
cnF2freq是一种用于计算基因型和单倍型概率（包括估算缺失的基因型）的工具。 该代码已经存在多个版本，但是从2015年2月开始，版本控制在github上完成。 这里介绍的第一个fork是PlantImpute分支。
该代码或多或少是C ++文件的一个整体，但是目的是最终将其清理干净。 使用适合您的任何优化设置来编译该文件。 自动向量化和严格的别名规则可以极大地提高代码的性能。
对于任何学术用途，除遵循BSD许可外，还鼓励引用以下参考文献：cnf2freq：使用markov模型C Nettelblad，S Holmgren，L Crooks，ÖCarlborg-生物信息学和计算学来有效测定近亲群体的基因型和单倍型概率生物学，2009年
推断较大的完整同胞和其他谱系中缺少或错误的基因型数据的单倍型和亲本基因型C Nettelblad-BMC Genetics，201
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