文件名称:
paralogy_resolution_tutorial:容器化的Yang和Smith参数解析管道的GAP教程-源码
开发工具:
文件大小: 16kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-15
详细说明:HybSeq参数解析教程
容器化的Yang和Smith参数解析管道的GAP教程
链接到
本教程假定您已经安装了Singularity和Nextflow,并且已经下载了Y_and_S Singularity映像。 另外,您应该具有Nextflow管道脚本yang_and_smith_pipeline_v1_7.nf及其对应的配置文件yang_and_smith.config 。
在此处[LINK]通过Vagrant在OSX上运行的安装说明。
有关在此处[LINK]为您的计算资源自定义Nextflow配置文件的说明。
输入数据
旁系同源序列
如果您已使用Nextflow管道hybpiper_pipeline_v1_7.nf运行HybPiper,它将在您的主要results文件夹中生成以下子文件夹:
11_paralogs
12_paralogs_noChimeras
有关这些输出文
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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