文件名称:
HistoQC-Tiling:对HistoQC的切片支持-源码
开发工具:
文件大小: 7kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-15
详细说明：HistoQC平铺
对HistoQC的切片支持
这套程序和指令将基于进行质量控制分析，将高档的结果HistoQC蒙版与原始幻灯片分辨率相匹配，并基于给定的高档蒙版将幻灯片与HistoQC识别的有用区域进行平铺。
HistoQC安装：您可以参考安装说明，但是我建议您使用 。 只需将其复制到单独文件夹中的计算机上，并使用以下命令进行构建： docker build --no-cache -t histoqc/histoqc --build-arg user=YOUR_USERNAME -f HQC_Dockerfile . 不要忘记指定主机名，否则您冒着以root用户身份运行docker的风险，并且如果您的计算机上没有sudo，您将无法访问所有生成的文件。
运行HistoQC ：要在我的容器中运行HistoQC，您可以： docker run --rm -it -v /hdd:/mnt h
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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