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PHP:原核病毒宿主预测器（PHP）是基于高斯模型（GM）的原核病毒宿主预测的计算工具。 PHP将原核病毒的完整或部分基因组序列作为输入。 对于每个病毒序列，PHP自动计算60,105个原核基因组的宿主概率，并以概率最大的原核基因组作为预测
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文件大小: 77mb
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上传时间: 2021-03-15
详细说明：原核病毒宿主预测因子（PHP）
原核病毒宿主预测器（PHP）是一种基于高斯模型（GM）的原核病毒宿主预测的计算工具。 PHP将原核病毒的完整或部分基因组序列作为输入。 对于每个病毒序列，PHP自动计算60,105个原核基因组的宿主概率，并以概率最大的原核基因组作为预测宿主。 PHP将输出得分最高的原核基因组名称，并输出所有原核基因组的宿主分数。 Python包pandas ， numpy ， sklearn需要phageHostPredictor安装之前安装。 该程序需要在Linux操作系统上运行
依存关系：
Python 3，numpy，pandas，scikit-learn
pip install pandas
pip install numpy
pip install -U scikit-learn
用法：
步骤1：计算主机的K- mer频率
python3 countKmer.
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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