文件名称:
Rosetta_Kinase_CM:抑制剂-激酶复合物的比较模型-源码
开发工具:
文件大小: 87mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明：罗塞塔激酶CM
相依性
经过 （Pandas）测试
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这是用于比较建模管道方法的步骤和脚本，
1.整合子生成和配体比对（modeling_script.py）
首先，将使用OMEGA为给定的SMILES生成最大数目的构象子。 输出将是单个SDF文件，具有最大数量的构象器。
其次，将使用ROCS将单个SDF文件用于查询（感兴趣的分子）和数据库（内部活性激酶配体模板库）分子的比对。 输出将是每个模板对齐的查询分子。
第三，将每个模板对齐的查询分子的报告文件组合到单个报告文件中。
第四，基于单个报告文件，选择给定SMILES的前100个符合性。
第五，将使用100个构象程序生成SDF到PARAMS，以进行Rosetta最小化步骤。
python modeling_script.py -f /path/to/2W1C_A_L0C -omega /p
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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