文件名称:
miRDriver:用于推断癌症中拷贝数衍生的miRNA基因网络的计算工具-源码
开发工具:
文件大小: 1mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明:miRDriver
R包miRDriver使用GISTIC识别频繁畸变的区域,并计算两个患者组之间的差异表达基因,即频繁畸变组和非频繁畸变组。 利用拷贝数畸变,DNA甲基化,基因表达,转录因子表达和miRNA表达数据集,miRDriver应用了基于LASSO的方法来选择miRNA与靶标基因的相互作用。 我们对来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库的乳腺癌和卵巢癌数据进行了miRDriver测试。
请遵循R文件夹中的源代码。
miRDriver正在建设中,将作为Bioconductor R软件包发布
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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