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下载次数: 0
上传时间: 2021-03-14
详细说明：瘦均蛋白机！
目录
项目概况
蛋白质的基于结构的设计在纳米颗粒疫苗中显示出巨大的希望。 然而，设计和纳米颗粒的功能和使用的主要障碍之一是次优分泌。 在这个项目中，我们分析了三种不同生物（人类，酵母和大肠杆菌）中的蛋白质，以将亚细胞位置与遗传可编码特征相关联。 我们还添加了扩展此模型的选项，以包括跨膜电位，二级结构螺旋的百分数和氨基酸的柔韧性。 这些模型可预测蛋白质属于分泌类的可能性。 我们还添加了将点突变引入设计的蛋白质中以提高分泌分数的功能。
依存关系
用于计算分子生物学的工具，包括序列转换实用程序
数据组织框架
数值运算
监督机器学习模型
高效的数学库，针对加速线性代数（XLA）进行了优化
用于施加编码序列蛋白的范例库， ，用JAX代替Tensorflow实现
入门
克隆存储库：
https://github.com/Lean-Mean-Protein-Machine-Lear
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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