文件名称:
Final_Reports:此回购包含使用与wtdbg2组装的Pacbio序列数据,从帝王蟹基因组组装获得的结果-源码
开发工具:
文件大小: 3kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-12
详细说明:帝王蟹基因组大会
PacBio CLR数据,下采样至75%ZMW,与wtdbg2组合
Derrik Gratz,Jonas Grove,Chris Chua,Susan Collins,Cameron Watson
对ZMW进行下采样
以随机方式进行采样的目的是进行下采样,以使特定的读取子集不会有偏差地进行采样。 为此,在读取前75%的数据之前,先对数据文件进行混洗。 使用文件的位大小计算数据百分比,以使下采样的数据集涵盖总起始序列数据的75%。
有关更多信息,请参见DownSamplingReport.MD。
设置Conda环境
conda创建--name红豆conda激活红豆conda配置-添加通道bioconda conda config-添加通道conda-forge conda安装-c bioconda wtdbg
运行wtdbg2(redbean)
用法: wtdbg2 [
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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