文件名称:
PMDfinder:从全基因组亚硫酸氢盐测序数据中识别部分甲基化结构域的管道-源码
开发工具:
文件大小: 74kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-11
详细说明:PMD查找器
从全基因组亚硫酸氢盐测序数据中识别部分甲基化结构域的管道
朱一惠
运行PMDfinder:
首先以DSS文件格式准备WGBS数据。
DSS档案格式:
输入文件应按每个样本和每个染色体进行拆分。 格式应为DSS,它是一个制表符分隔的文本文件,具有4列:染色体(chr),位置(pos),总读数(N)和甲基化读数(X)(请参见下文)。
chr pos N X
chr21 5013971 1 1
chr21 5014046 1 1
chr21 5014056 1 1
chr21 5014082 1 1
chr21 5014097 1 0
PMDfinder工作流程图
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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