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上传时间: 2021-03-11
详细说明：˚Filtering一个次我在卡内基梅隆大学，2021Spring杰里米·费希尔，西蒙·莱文，希德里德和托马斯·马特森dentifyingň导通^ h OST d NA管道为03-713生物信息学实习
fainhD执行以下操作
过滤RNA-seq数据以去除宿主序列
将未知序列组装到重叠群中
针对已知病毒的BLAST病毒序列
预测病毒序列中的功能性ORF
搜索病毒序列中的结构元素
它需要一个Illumina配对读取的测序文件，并将它们报告到具有以下各列的json-lines文件中：
query_name ：contig组装软件分配的任意名称
contiq_seq ：连续的DNA序列本身
rfam_e_value ：向rfam结构数据库查询的期望值
blast_results ：成对的基因座和来自BLAST的sseqid ，其中键sseqid为基因座， evalue为期望值
完成后，此报告
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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