文件名称:
使用修剪算法和全局评分预测具有多个茎环的pre-miRNA
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文件大小: 71kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-10
详细说明：在大多数现有的预测方法中，通常不包括具有多个环的那些pre-miRNA。 但是，随着越来越多的miRNA被鉴定，已经发现了具有多个环的miRNA前体的数量。 因此，确定如何从那些具有多个环的大型伪pre-miRNA中有效预测具有多个环的真实pre-miRNA是当务之急。 提取主分支的一些特征以描述pre-miRNA的固有特征，并实施SVM分类器以识别具有多个茎环的真实pre-miRNA。 在来自miRBase12.0的数据集上进行训练和测试，SVM分类器在人体测试集上达到75.76％的灵敏度和95.16％的特异性，并且将其应用于所有其他物种的pre-miRNA时，可以正确识别其中的86.71％。 这项工作中提出的方法提供了一种强大的预测方法，可以识别具有多个茎环的真正的pre-miRNA。
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