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BIMLR:一种从根系系统树中构建根系系统网络的方法
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文件大小: 756kb
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上传时间: 2021-03-09
详细说明:从不同数据集(例如,从不同基因)构建的根系系统树通常彼此冲突,即它们无法整合到单个系统树中。 系统发育网络已成为分子进化中的重要工具,有根的系统树可以代表有冲突的有根的系统树。 因此,开发从根系系统树计算根系系统网络的适当方法近来引起了相当大的研究兴趣。 van Iersel等人提出的C-ASS算法。 与其他可用方法相比,它能够构建简单得多的网络,但是它非常慢,并且它构建的网络取决于输入数据的顺序。 在这里,我们介绍一种改进的C-ASS算法BIMLR。 我们显示BIMLR比C-ASS更快,并且对输入数据顺序的依赖性较小。 此外,与几乎所有其他方法相比,BIMLR能够构建简单得多的网络。 BIMLR可从http://nclab.hit.edu.cn/wangjuan/BIMLR/获得。
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