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上传时间: 2021-03-09
详细说明:Rbec:分析合成微生物群落中扩增子测序数据的工具
我们的手稿目前可以在作为预印本。
Rbec是用于分析来自合成社区(SynComs)的扩增子测序数据的工具,其中每个菌株的参考序列均已可用。 Rbec可以准确纠正PCR和测序错误,识别种内多态变异,并检测SynCom扩增子数据中的污染。
安装
Rbec是免费的R包。 要安装Rbec,需要预先使用以下命令手动安装'dada2'软件包( ):
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("dada2", version = "3.11")
然后,您可以直接下载源包(Rbec_0.1.0.tar.gz)并在本地安装它:
install.packages("Rbec
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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